Protein–RNA interactions for Protein: P29353

SHC1, SHC-transforming protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC1P29353 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SHC1P29353 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SHC1P29353 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SHC1P29353 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SHC1P29353 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SHC1P29353 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SHC1P29353 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SHC1P29353 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SHC1P29353 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SHC1P29353 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SHC1P29353 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SHC1P29353 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SHC1P29353 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SHC1P29353 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SHC1P29353 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SHC1P29353 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SHC1P29353 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SHC1P29353 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SHC1P29353 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SHC1P29353 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SHC1P29353 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SHC1P29353 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SHC1P29353 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SHC1P29353 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SHC1P29353 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SHC1P29353 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SHC1P29353 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
SHC1P29353 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SHC1P29353 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SHC1P29353 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SHC1P29353 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SHC1P29353 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SHC1P29353 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SHC1P29353 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SHC1P29353 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SHC1P29353 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SHC1P29353 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SHC1P29353 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SHC1P29353 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SHC1P29353 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SHC1P29353 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SHC1P29353 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SHC1P29353 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SHC1P29353 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SHC1P29353 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SHC1P29353 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SHC1P29353 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SHC1P29353 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SHC1P29353 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SHC1P29353 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SHC1P29353 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SHC1P29353 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SHC1P29353 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SHC1P29353 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SHC1P29353 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SHC1P29353 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SHC1P29353 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SHC1P29353 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SHC1P29353 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SHC1P29353 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SHC1P29353 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SHC1P29353 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SHC1P29353 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SHC1P29353 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SHC1P29353 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SHC1P29353 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SHC1P29353 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SHC1P29353 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SHC1P29353 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SHC1P29353 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SHC1P29353 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SHC1P29353 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SHC1P29353 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SHC1P29353 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SHC1P29353 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SHC1P29353 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SHC1P29353 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SHC1P29353 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SHC1P29353 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SHC1P29353 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SHC1P29353 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SHC1P29353 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SHC1P29353 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SHC1P29353 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SHC1P29353 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SHC1P29353 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SHC1P29353 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SHC1P29353 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SHC1P29353 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SHC1P29353 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SHC1P29353 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SHC1P29353 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SHC1P29353 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SHC1P29353 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SHC1P29353 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SHC1P29353 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SHC1P29353 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SHC1P29353 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SHC1P29353 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SHC1P29353 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.1 ms