Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKCHP24723 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKCHP24723 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKCHP24723 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKCHP24723 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKCHP24723 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKCHP24723 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKCHP24723 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKCHP24723 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKCHP24723 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKCHP24723 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKCHP24723 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKCHP24723 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRKCHP24723 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRKCHP24723 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRKCHP24723 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRKCHP24723 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKCHP24723 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKCHP24723 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKCHP24723 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKCHP24723 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKCHP24723 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKCHP24723 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKCHP24723 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKCHP24723 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRKCHP24723 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PRKCHP24723 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKCHP24723 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKCHP24723 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKCHP24723 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKCHP24723 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKCHP24723 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKCHP24723 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKCHP24723 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKCHP24723 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKCHP24723 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKCHP24723 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKCHP24723 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKCHP24723 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKCHP24723 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKCHP24723 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKCHP24723 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKCHP24723 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKCHP24723 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKCHP24723 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKCHP24723 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKCHP24723 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKCHP24723 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKCHP24723 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKCHP24723 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRKCHP24723 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRKCHP24723 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRKCHP24723 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRKCHP24723 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PRKCHP24723 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRKCHP24723 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRKCHP24723 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PRKCHP24723 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKCHP24723 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKCHP24723 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKCHP24723 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKCHP24723 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKCHP24723 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKCHP24723 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKCHP24723 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKCHP24723 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKCHP24723 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKCHP24723 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKCHP24723 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKCHP24723 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKCHP24723 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKCHP24723 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKCHP24723 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKCHP24723 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRKCHP24723 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRKCHP24723 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRKCHP24723 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRKCHP24723 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRKCHP24723 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRKCHP24723 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRKCHP24723 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKCHP24723 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKCHP24723 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKCHP24723 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKCHP24723 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKCHP24723 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKCHP24723 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKCHP24723 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKCHP24723 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKCHP24723 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKCHP24723 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKCHP24723 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKCHP24723 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKCHP24723 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKCHP24723 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKCHP24723 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKCHP24723 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKCHP24723 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKCHP24723 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKCHP24723 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
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