Protein–RNA interactions for Protein: P23610

F8A1, Factor VIII intron 22 protein, humanhuman

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8A1P23610 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
F8A1P23610 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
F8A1P23610 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
F8A1P23610 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
F8A1P23610 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
F8A1P23610 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
F8A1P23610 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
F8A1P23610 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
F8A1P23610 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
F8A1P23610 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
F8A1P23610 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
F8A1P23610 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
F8A1P23610 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
F8A1P23610 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
F8A1P23610 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
F8A1P23610 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
F8A1P23610 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
F8A1P23610 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
F8A1P23610 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
F8A1P23610 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
F8A1P23610 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
F8A1P23610 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
F8A1P23610 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
F8A1P23610 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
F8A1P23610 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
F8A1P23610 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
F8A1P23610 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
F8A1P23610 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
F8A1P23610 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
F8A1P23610 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
F8A1P23610 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
F8A1P23610 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
F8A1P23610 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
F8A1P23610 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
F8A1P23610 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
F8A1P23610 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
F8A1P23610 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
F8A1P23610 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
F8A1P23610 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
F8A1P23610 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
F8A1P23610 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
F8A1P23610 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
F8A1P23610 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
F8A1P23610 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
F8A1P23610 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
F8A1P23610 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
F8A1P23610 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
F8A1P23610 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
F8A1P23610 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
F8A1P23610 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
F8A1P23610 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
F8A1P23610 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
F8A1P23610 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
F8A1P23610 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
F8A1P23610 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
F8A1P23610 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
F8A1P23610 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
F8A1P23610 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
F8A1P23610 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
F8A1P23610 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
F8A1P23610 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
F8A1P23610 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
F8A1P23610 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
F8A1P23610 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
F8A1P23610 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
F8A1P23610 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
F8A1P23610 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
F8A1P23610 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
F8A1P23610 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
F8A1P23610 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
F8A1P23610 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
F8A1P23610 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
F8A1P23610 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
F8A1P23610 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
F8A1P23610 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
F8A1P23610 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
F8A1P23610 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
F8A1P23610 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
F8A1P23610 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
F8A1P23610 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
F8A1P23610 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
F8A1P23610 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
F8A1P23610 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
F8A1P23610 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
F8A1P23610 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
F8A1P23610 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
F8A1P23610 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
F8A1P23610 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
F8A1P23610 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
F8A1P23610 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
F8A1P23610 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
F8A1P23610 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
F8A1P23610 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
F8A1P23610 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
F8A1P23610 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
F8A1P23610 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
F8A1P23610 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
F8A1P23610 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
F8A1P23610 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
F8A1P23610 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms