Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPREP23469 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTPREP23469 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTPREP23469 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPREP23469 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPREP23469 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPREP23469 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPREP23469 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPREP23469 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPREP23469 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPREP23469 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPREP23469 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPREP23469 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPREP23469 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPREP23469 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPREP23469 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPREP23469 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPREP23469 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPREP23469 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPREP23469 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPREP23469 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPREP23469 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPREP23469 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPREP23469 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPREP23469 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPREP23469 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPREP23469 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPREP23469 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPREP23469 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPREP23469 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPREP23469 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPREP23469 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPREP23469 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPREP23469 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PTPREP23469 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPREP23469 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPREP23469 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPREP23469 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPREP23469 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPREP23469 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPREP23469 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPREP23469 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPREP23469 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPREP23469 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPREP23469 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPREP23469 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPREP23469 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPREP23469 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPREP23469 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPREP23469 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPREP23469 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPREP23469 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPREP23469 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPREP23469 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPREP23469 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPREP23469 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPREP23469 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPREP23469 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPREP23469 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPREP23469 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPREP23469 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPREP23469 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPREP23469 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPREP23469 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPREP23469 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPREP23469 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPREP23469 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPREP23469 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPREP23469 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPREP23469 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPREP23469 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPREP23469 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPREP23469 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPREP23469 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPREP23469 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPREP23469 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPREP23469 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPREP23469 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPREP23469 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPREP23469 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPREP23469 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPREP23469 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPREP23469 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPREP23469 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPREP23469 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPREP23469 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPREP23469 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPREP23469 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPREP23469 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPREP23469 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPREP23469 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPREP23469 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPREP23469 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPREP23469 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPREP23469 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPREP23469 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPREP23469 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPREP23469 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPREP23469 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPREP23469 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms