Protein–RNA interactions for Protein: P15529

CD46, Membrane cofactor protein, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46P15529 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD46P15529 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD46P15529 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD46P15529 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD46P15529 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CD46P15529 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD46P15529 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD46P15529 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CD46P15529 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CD46P15529 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD46P15529 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD46P15529 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CD46P15529 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD46P15529 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD46P15529 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD46P15529 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD46P15529 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD46P15529 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD46P15529 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD46P15529 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD46P15529 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD46P15529 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD46P15529 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD46P15529 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD46P15529 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD46P15529 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD46P15529 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD46P15529 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD46P15529 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD46P15529 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD46P15529 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD46P15529 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD46P15529 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD46P15529 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD46P15529 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD46P15529 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD46P15529 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD46P15529 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD46P15529 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD46P15529 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD46P15529 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD46P15529 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD46P15529 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD46P15529 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD46P15529 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD46P15529 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD46P15529 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD46P15529 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD46P15529 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD46P15529 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD46P15529 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD46P15529 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD46P15529 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD46P15529 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD46P15529 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD46P15529 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD46P15529 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD46P15529 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD46P15529 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD46P15529 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CD46P15529 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD46P15529 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD46P15529 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD46P15529 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD46P15529 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD46P15529 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD46P15529 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD46P15529 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD46P15529 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CD46P15529 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CD46P15529 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD46P15529 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD46P15529 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD46P15529 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD46P15529 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD46P15529 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD46P15529 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD46P15529 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD46P15529 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CD46P15529 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD46P15529 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD46P15529 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD46P15529 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD46P15529 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD46P15529 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD46P15529 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CD46P15529 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD46P15529 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD46P15529 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD46P15529 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD46P15529 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD46P15529 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD46P15529 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD46P15529 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD46P15529 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD46P15529 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CD46P15529 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD46P15529 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD46P15529 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD46P15529 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms