Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGA4P13612 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGA4P13612 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGA4P13612 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGA4P13612 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGA4P13612 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGA4P13612 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGA4P13612 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGA4P13612 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ITGA4P13612 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ITGA4P13612 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ITGA4P13612 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ITGA4P13612 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ITGA4P13612 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ITGA4P13612 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ITGA4P13612 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ITGA4P13612 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ITGA4P13612 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
ITGA4P13612 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGA4P13612 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGA4P13612 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGA4P13612 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGA4P13612 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGA4P13612 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGA4P13612 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGA4P13612 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGA4P13612 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGA4P13612 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGA4P13612 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGA4P13612 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGA4P13612 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGA4P13612 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGA4P13612 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGA4P13612 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGA4P13612 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGA4P13612 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGA4P13612 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGA4P13612 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGA4P13612 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGA4P13612 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGA4P13612 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGA4P13612 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGA4P13612 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGA4P13612 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGA4P13612 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGA4P13612 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGA4P13612 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGA4P13612 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGA4P13612 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGA4P13612 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGA4P13612 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGA4P13612 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGA4P13612 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGA4P13612 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGA4P13612 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGA4P13612 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGA4P13612 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGA4P13612 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGA4P13612 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGA4P13612 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGA4P13612 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGA4P13612 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGA4P13612 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGA4P13612 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGA4P13612 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGA4P13612 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGA4P13612 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGA4P13612 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGA4P13612 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGA4P13612 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGA4P13612 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGA4P13612 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGA4P13612 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGA4P13612 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGA4P13612 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGA4P13612 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGA4P13612 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGA4P13612 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGA4P13612 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGA4P13612 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGA4P13612 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGA4P13612 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGA4P13612 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGA4P13612 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGA4P13612 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGA4P13612 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGA4P13612 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGA4P13612 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGA4P13612 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGA4P13612 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGA4P13612 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGA4P13612 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGA4P13612 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGA4P13612 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGA4P13612 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGA4P13612 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGA4P13612 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGA4P13612 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGA4P13612 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGA4P13612 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms