Protein–RNA interactions for Protein: P11277

SPTB, Spectrin beta chain, erythrocytic, humanhuman

Predictions only

Length 2,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBP11277 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SPTBP11277 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SPTBP11277 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPTBP11277 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPTBP11277 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPTBP11277 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPTBP11277 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPTBP11277 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPTBP11277 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SPTBP11277 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPTBP11277 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPTBP11277 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
SPTBP11277 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SPTBP11277 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
SPTBP11277 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPTBP11277 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPTBP11277 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPTBP11277 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPTBP11277 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPTBP11277 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPTBP11277 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SPTBP11277 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPTBP11277 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPTBP11277 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPTBP11277 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTBP11277 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTBP11277 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTBP11277 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTBP11277 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTBP11277 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTBP11277 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTBP11277 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPTBP11277 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPTBP11277 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPTBP11277 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPTBP11277 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SPTBP11277 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPTBP11277 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPTBP11277 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPTBP11277 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPTBP11277 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPTBP11277 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SPTBP11277 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPTBP11277 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPTBP11277 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPTBP11277 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPTBP11277 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPTBP11277 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SPTBP11277 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPTBP11277 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPTBP11277 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPTBP11277 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPTBP11277 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPTBP11277 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SPTBP11277 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPTBP11277 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPTBP11277 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPTBP11277 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPTBP11277 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPTBP11277 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPTBP11277 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPTBP11277 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPTBP11277 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPTBP11277 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPTBP11277 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPTBP11277 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPTBP11277 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPTBP11277 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPTBP11277 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPTBP11277 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPTBP11277 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPTBP11277 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPTBP11277 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPTBP11277 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPTBP11277 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPTBP11277 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPTBP11277 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPTBP11277 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPTBP11277 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPTBP11277 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPTBP11277 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPTBP11277 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPTBP11277 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPTBP11277 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPTBP11277 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPTBP11277 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPTBP11277 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPTBP11277 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPTBP11277 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPTBP11277 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPTBP11277 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPTBP11277 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPTBP11277 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPTBP11277 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPTBP11277 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SPTBP11277 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SPTBP11277 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPTBP11277 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPTBP11277 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPTBP11277 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms