Protein–RNA interactions for Protein: O75534

CSDE1, Cold shock domain-containing protein E1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1O75534 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CSDE1O75534 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CSDE1O75534 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CSDE1O75534 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CSDE1O75534 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CSDE1O75534 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CSDE1O75534 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CSDE1O75534 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CSDE1O75534 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CSDE1O75534 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CSDE1O75534 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CSDE1O75534 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CSDE1O75534 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CSDE1O75534 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CSDE1O75534 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CSDE1O75534 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CSDE1O75534 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CSDE1O75534 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CSDE1O75534 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CSDE1O75534 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CSDE1O75534 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CSDE1O75534 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CSDE1O75534 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CSDE1O75534 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CSDE1O75534 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CSDE1O75534 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CSDE1O75534 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CSDE1O75534 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CSDE1O75534 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CSDE1O75534 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CSDE1O75534 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CSDE1O75534 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CSDE1O75534 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CSDE1O75534 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CSDE1O75534 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CSDE1O75534 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CSDE1O75534 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CSDE1O75534 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CSDE1O75534 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CSDE1O75534 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CSDE1O75534 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CSDE1O75534 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CSDE1O75534 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CSDE1O75534 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CSDE1O75534 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CSDE1O75534 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CSDE1O75534 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CSDE1O75534 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CSDE1O75534 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CSDE1O75534 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CSDE1O75534 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CSDE1O75534 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CSDE1O75534 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CSDE1O75534 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CSDE1O75534 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CSDE1O75534 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CSDE1O75534 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CSDE1O75534 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CSDE1O75534 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CSDE1O75534 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CSDE1O75534 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CSDE1O75534 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CSDE1O75534 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CSDE1O75534 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CSDE1O75534 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CSDE1O75534 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CSDE1O75534 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CSDE1O75534 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CSDE1O75534 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CSDE1O75534 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CSDE1O75534 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CSDE1O75534 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CSDE1O75534 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CSDE1O75534 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CSDE1O75534 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CSDE1O75534 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CSDE1O75534 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CSDE1O75534 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CSDE1O75534 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CSDE1O75534 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CSDE1O75534 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CSDE1O75534 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CSDE1O75534 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CSDE1O75534 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CSDE1O75534 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CSDE1O75534 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CSDE1O75534 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CSDE1O75534 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CSDE1O75534 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CSDE1O75534 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CSDE1O75534 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CSDE1O75534 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CSDE1O75534 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CSDE1O75534 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CSDE1O75534 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CSDE1O75534 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CSDE1O75534 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CSDE1O75534 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CSDE1O75534 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
CSDE1O75534 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms