Protein–RNA interactions for Protein: O75167

PHACTR2, Phosphatase and actin regulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR2O75167 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PHACTR2O75167 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PHACTR2O75167 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PHACTR2O75167 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PHACTR2O75167 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PHACTR2O75167 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PHACTR2O75167 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PHACTR2O75167 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PHACTR2O75167 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PHACTR2O75167 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PHACTR2O75167 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PHACTR2O75167 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PHACTR2O75167 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PHACTR2O75167 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PHACTR2O75167 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PHACTR2O75167 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PHACTR2O75167 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PHACTR2O75167 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PHACTR2O75167 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PHACTR2O75167 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PHACTR2O75167 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PHACTR2O75167 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PHACTR2O75167 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PHACTR2O75167 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PHACTR2O75167 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PHACTR2O75167 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PHACTR2O75167 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PHACTR2O75167 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHACTR2O75167 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHACTR2O75167 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHACTR2O75167 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHACTR2O75167 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PHACTR2O75167 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PHACTR2O75167 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PHACTR2O75167 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PHACTR2O75167 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PHACTR2O75167 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PHACTR2O75167 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PHACTR2O75167 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PHACTR2O75167 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PHACTR2O75167 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PHACTR2O75167 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PHACTR2O75167 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHACTR2O75167 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHACTR2O75167 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHACTR2O75167 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PHACTR2O75167 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHACTR2O75167 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHACTR2O75167 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHACTR2O75167 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHACTR2O75167 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHACTR2O75167 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PHACTR2O75167 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PHACTR2O75167 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PHACTR2O75167 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PHACTR2O75167 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PHACTR2O75167 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PHACTR2O75167 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PHACTR2O75167 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PHACTR2O75167 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHACTR2O75167 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHACTR2O75167 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHACTR2O75167 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHACTR2O75167 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHACTR2O75167 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHACTR2O75167 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHACTR2O75167 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHACTR2O75167 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHACTR2O75167 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PHACTR2O75167 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHACTR2O75167 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHACTR2O75167 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PHACTR2O75167 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PHACTR2O75167 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PHACTR2O75167 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PHACTR2O75167 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PHACTR2O75167 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHACTR2O75167 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PHACTR2O75167 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHACTR2O75167 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHACTR2O75167 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PHACTR2O75167 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHACTR2O75167 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHACTR2O75167 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHACTR2O75167 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHACTR2O75167 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHACTR2O75167 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHACTR2O75167 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHACTR2O75167 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHACTR2O75167 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHACTR2O75167 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHACTR2O75167 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHACTR2O75167 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHACTR2O75167 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHACTR2O75167 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHACTR2O75167 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHACTR2O75167 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHACTR2O75167 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHACTR2O75167 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHACTR2O75167 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms