Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
IGSF3O75054 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
IGSF3O75054 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
IGSF3O75054 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
IGSF3O75054 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
IGSF3O75054 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
IGSF3O75054 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
IGSF3O75054 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
IGSF3O75054 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
IGSF3O75054 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29■■■□□ 2.23
IGSF3O75054 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
IGSF3O75054 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
IGSF3O75054 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
IGSF3O75054 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
IGSF3O75054 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
IGSF3O75054 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
IGSF3O75054 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
IGSF3O75054 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
IGSF3O75054 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
IGSF3O75054 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
IGSF3O75054 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
IGSF3O75054 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
IGSF3O75054 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
IGSF3O75054 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
IGSF3O75054 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
IGSF3O75054 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
IGSF3O75054 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
IGSF3O75054 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
IGSF3O75054 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
IGSF3O75054 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
IGSF3O75054 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
IGSF3O75054 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
IGSF3O75054 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
IGSF3O75054 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
IGSF3O75054 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
IGSF3O75054 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
IGSF3O75054 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
IGSF3O75054 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
IGSF3O75054 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
IGSF3O75054 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
IGSF3O75054 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
IGSF3O75054 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
IGSF3O75054 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
IGSF3O75054 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
IGSF3O75054 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
IGSF3O75054 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
IGSF3O75054 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
IGSF3O75054 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
IGSF3O75054 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
IGSF3O75054 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
IGSF3O75054 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
IGSF3O75054 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
IGSF3O75054 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
IGSF3O75054 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
IGSF3O75054 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
IGSF3O75054 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
IGSF3O75054 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
IGSF3O75054 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
IGSF3O75054 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
IGSF3O75054 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
IGSF3O75054 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
IGSF3O75054 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
IGSF3O75054 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
IGSF3O75054 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
IGSF3O75054 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
IGSF3O75054 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
IGSF3O75054 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
IGSF3O75054 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
IGSF3O75054 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
IGSF3O75054 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
IGSF3O75054 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
IGSF3O75054 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
IGSF3O75054 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
IGSF3O75054 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
IGSF3O75054 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
IGSF3O75054 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
IGSF3O75054 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
IGSF3O75054 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
IGSF3O75054 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
IGSF3O75054 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
IGSF3O75054 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
IGSF3O75054 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
IGSF3O75054 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
IGSF3O75054 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
IGSF3O75054 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
IGSF3O75054 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
IGSF3O75054 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
IGSF3O75054 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
IGSF3O75054 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
IGSF3O75054 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
IGSF3O75054 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
IGSF3O75054 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
IGSF3O75054 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
IGSF3O75054 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
IGSF3O75054 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
IGSF3O75054 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
IGSF3O75054 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
IGSF3O75054 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
IGSF3O75054 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
IGSF3O75054 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.5 ms