Protein–RNA interactions for Protein: O60216

RAD21, Double-strand-break repair protein rad21 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD21O60216 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RAD21O60216 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RAD21O60216 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RAD21O60216 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RAD21O60216 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RAD21O60216 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RAD21O60216 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RAD21O60216 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RAD21O60216 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RAD21O60216 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RAD21O60216 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RAD21O60216 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RAD21O60216 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RAD21O60216 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RAD21O60216 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RAD21O60216 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RAD21O60216 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RAD21O60216 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RAD21O60216 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RAD21O60216 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RAD21O60216 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
RAD21O60216 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RAD21O60216 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RAD21O60216 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RAD21O60216 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
RAD21O60216 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RAD21O60216 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RAD21O60216 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RAD21O60216 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RAD21O60216 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RAD21O60216 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RAD21O60216 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
RAD21O60216 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RAD21O60216 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RAD21O60216 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RAD21O60216 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
RAD21O60216 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RAD21O60216 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RAD21O60216 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RAD21O60216 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RAD21O60216 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RAD21O60216 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RAD21O60216 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RAD21O60216 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RAD21O60216 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RAD21O60216 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RAD21O60216 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RAD21O60216 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RAD21O60216 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RAD21O60216 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RAD21O60216 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RAD21O60216 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
RAD21O60216 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RAD21O60216 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RAD21O60216 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RAD21O60216 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RAD21O60216 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RAD21O60216 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RAD21O60216 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RAD21O60216 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RAD21O60216 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RAD21O60216 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RAD21O60216 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RAD21O60216 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RAD21O60216 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAD21O60216 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAD21O60216 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAD21O60216 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAD21O60216 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAD21O60216 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAD21O60216 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAD21O60216 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAD21O60216 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
RAD21O60216 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAD21O60216 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAD21O60216 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAD21O60216 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAD21O60216 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAD21O60216 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAD21O60216 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
RAD21O60216 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAD21O60216 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
RAD21O60216 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAD21O60216 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAD21O60216 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAD21O60216 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAD21O60216 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAD21O60216 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAD21O60216 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAD21O60216 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAD21O60216 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAD21O60216 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAD21O60216 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAD21O60216 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAD21O60216 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAD21O60216 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAD21O60216 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAD21O60216 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAD21O60216 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAD21O60216 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms