Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COCHO43405 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
COCHO43405 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
COCHO43405 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
COCHO43405 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
COCHO43405 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COCHO43405 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COCHO43405 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
COCHO43405 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COCHO43405 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COCHO43405 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COCHO43405 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COCHO43405 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COCHO43405 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COCHO43405 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COCHO43405 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COCHO43405 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COCHO43405 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COCHO43405 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COCHO43405 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COCHO43405 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COCHO43405 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COCHO43405 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COCHO43405 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COCHO43405 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COCHO43405 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COCHO43405 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COCHO43405 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COCHO43405 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COCHO43405 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COCHO43405 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COCHO43405 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COCHO43405 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COCHO43405 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COCHO43405 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COCHO43405 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COCHO43405 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COCHO43405 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COCHO43405 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COCHO43405 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COCHO43405 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COCHO43405 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COCHO43405 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COCHO43405 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COCHO43405 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COCHO43405 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COCHO43405 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25■■□□□ 1.59
COCHO43405 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COCHO43405 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
COCHO43405 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COCHO43405 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
COCHO43405 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COCHO43405 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
COCHO43405 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COCHO43405 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COCHO43405 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COCHO43405 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COCHO43405 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COCHO43405 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COCHO43405 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COCHO43405 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COCHO43405 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COCHO43405 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COCHO43405 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COCHO43405 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COCHO43405 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COCHO43405 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COCHO43405 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COCHO43405 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COCHO43405 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COCHO43405 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COCHO43405 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COCHO43405 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COCHO43405 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COCHO43405 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COCHO43405 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COCHO43405 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COCHO43405 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COCHO43405 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COCHO43405 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COCHO43405 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COCHO43405 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COCHO43405 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COCHO43405 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
COCHO43405 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COCHO43405 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COCHO43405 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COCHO43405 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COCHO43405 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COCHO43405 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
COCHO43405 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COCHO43405 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COCHO43405 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COCHO43405 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COCHO43405 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COCHO43405 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COCHO43405 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COCHO43405 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
COCHO43405 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COCHO43405 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms