Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
SYNMO15061 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
SYNMO15061 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
SYNMO15061 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
SYNMO15061 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
SYNMO15061 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
SYNMO15061 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
SYNMO15061 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
SYNMO15061 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
SYNMO15061 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
SYNMO15061 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
SYNMO15061 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
SYNMO15061 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
SYNMO15061 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
SYNMO15061 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
SYNMO15061 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
SYNMO15061 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
SYNMO15061 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
SYNMO15061 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
SYNMO15061 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
SYNMO15061 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
SYNMO15061 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
SYNMO15061 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.23
SYNMO15061 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
SYNMO15061 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
SYNMO15061 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
SYNMO15061 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
SYNMO15061 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
SYNMO15061 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
SYNMO15061 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
SYNMO15061 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
SYNMO15061 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
SYNMO15061 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC35.25■■■■□ 3.23
SYNMO15061 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
SYNMO15061 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
SYNMO15061 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
SYNMO15061 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
SYNMO15061 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
SYNMO15061 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
SYNMO15061 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
SYNMO15061 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
SYNMO15061 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
SYNMO15061 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
SYNMO15061 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
SYNMO15061 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
SYNMO15061 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
SYNMO15061 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
SYNMO15061 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
SYNMO15061 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC35.21■■■■□ 3.23
SYNMO15061 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
SYNMO15061 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
SYNMO15061 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
SYNMO15061 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
SYNMO15061 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
SYNMO15061 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
SYNMO15061 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
SYNMO15061 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
SYNMO15061 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
SYNMO15061 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC35.17■■■■□ 3.22
SYNMO15061 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
SYNMO15061 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
SYNMO15061 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SYNMO15061 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC35.17■■■■□ 3.22
SYNMO15061 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
SYNMO15061 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
SYNMO15061 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SYNMO15061 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SYNMO15061 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SYNMO15061 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
SYNMO15061 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SYNMO15061 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
SYNMO15061 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
SYNMO15061 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
SYNMO15061 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC35.15■■■■□ 3.22
SYNMO15061 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC35.15■■■■□ 3.22
SYNMO15061 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
SYNMO15061 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
SYNMO15061 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
SYNMO15061 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
SYNMO15061 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
SYNMO15061 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
SYNMO15061 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
SYNMO15061 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
SYNMO15061 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
SYNMO15061 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
SYNMO15061 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
SYNMO15061 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
SYNMO15061 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
SYNMO15061 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
SYNMO15061 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
SYNMO15061 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
SYNMO15061 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
SYNMO15061 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC35.1■■■■□ 3.21
SYNMO15061 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
SYNMO15061 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
SYNMO15061 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
SYNMO15061 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
SYNMO15061 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
SYNMO15061 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
SYNMO15061 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms