Protein–RNA interactions for Protein: O00505

KPNA3, Importin subunit alpha-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA3O00505 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KPNA3O00505 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KPNA3O00505 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KPNA3O00505 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KPNA3O00505 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KPNA3O00505 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KPNA3O00505 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KPNA3O00505 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KPNA3O00505 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KPNA3O00505 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KPNA3O00505 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KPNA3O00505 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KPNA3O00505 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KPNA3O00505 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KPNA3O00505 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KPNA3O00505 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KPNA3O00505 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KPNA3O00505 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KPNA3O00505 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KPNA3O00505 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KPNA3O00505 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KPNA3O00505 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KPNA3O00505 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KPNA3O00505 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KPNA3O00505 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KPNA3O00505 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KPNA3O00505 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KPNA3O00505 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KPNA3O00505 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KPNA3O00505 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KPNA3O00505 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KPNA3O00505 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KPNA3O00505 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KPNA3O00505 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KPNA3O00505 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KPNA3O00505 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KPNA3O00505 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KPNA3O00505 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KPNA3O00505 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KPNA3O00505 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KPNA3O00505 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KPNA3O00505 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KPNA3O00505 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KPNA3O00505 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KPNA3O00505 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KPNA3O00505 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KPNA3O00505 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KPNA3O00505 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KPNA3O00505 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KPNA3O00505 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KPNA3O00505 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KPNA3O00505 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KPNA3O00505 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KPNA3O00505 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KPNA3O00505 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KPNA3O00505 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KPNA3O00505 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KPNA3O00505 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KPNA3O00505 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KPNA3O00505 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KPNA3O00505 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KPNA3O00505 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KPNA3O00505 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KPNA3O00505 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KPNA3O00505 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KPNA3O00505 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KPNA3O00505 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KPNA3O00505 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KPNA3O00505 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KPNA3O00505 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KPNA3O00505 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KPNA3O00505 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KPNA3O00505 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KPNA3O00505 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KPNA3O00505 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KPNA3O00505 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KPNA3O00505 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KPNA3O00505 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KPNA3O00505 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KPNA3O00505 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KPNA3O00505 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KPNA3O00505 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KPNA3O00505 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KPNA3O00505 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KPNA3O00505 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KPNA3O00505 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KPNA3O00505 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KPNA3O00505 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KPNA3O00505 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KPNA3O00505 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KPNA3O00505 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KPNA3O00505 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KPNA3O00505 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KPNA3O00505 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KPNA3O00505 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KPNA3O00505 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KPNA3O00505 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
KPNA3O00505 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
KPNA3O00505 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KPNA3O00505 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms