Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
PIK3C2AO00443 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PIK3C2AO00443 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PIK3C2AO00443 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PIK3C2AO00443 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PIK3C2AO00443 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PIK3C2AO00443 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
PIK3C2AO00443 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
PIK3C2AO00443 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
PIK3C2AO00443 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PIK3C2AO00443 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PIK3C2AO00443 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PIK3C2AO00443 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
PIK3C2AO00443 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PIK3C2AO00443 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PIK3C2AO00443 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PIK3C2AO00443 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PIK3C2AO00443 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PIK3C2AO00443 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PIK3C2AO00443 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PIK3C2AO00443 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PIK3C2AO00443 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
PIK3C2AO00443 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PIK3C2AO00443 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PIK3C2AO00443 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PIK3C2AO00443 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
PIK3C2AO00443 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PIK3C2AO00443 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PIK3C2AO00443 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PIK3C2AO00443 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PIK3C2AO00443 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PIK3C2AO00443 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PIK3C2AO00443 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
PIK3C2AO00443 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PIK3C2AO00443 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PIK3C2AO00443 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PIK3C2AO00443 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PIK3C2AO00443 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PIK3C2AO00443 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PIK3C2AO00443 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PIK3C2AO00443 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
PIK3C2AO00443 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PIK3C2AO00443 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
PIK3C2AO00443 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PIK3C2AO00443 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PIK3C2AO00443 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PIK3C2AO00443 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PIK3C2AO00443 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
PIK3C2AO00443 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
PIK3C2AO00443 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
PIK3C2AO00443 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
PIK3C2AO00443 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PIK3C2AO00443 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PIK3C2AO00443 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PIK3C2AO00443 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PIK3C2AO00443 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
PIK3C2AO00443 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PIK3C2AO00443 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
PIK3C2AO00443 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PIK3C2AO00443 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PIK3C2AO00443 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PIK3C2AO00443 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
PIK3C2AO00443 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
PIK3C2AO00443 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PIK3C2AO00443 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PIK3C2AO00443 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
PIK3C2AO00443 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PIK3C2AO00443 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
PIK3C2AO00443 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PIK3C2AO00443 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
PIK3C2AO00443 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
PIK3C2AO00443 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
PIK3C2AO00443 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PIK3C2AO00443 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PIK3C2AO00443 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PIK3C2AO00443 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PIK3C2AO00443 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PIK3C2AO00443 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PIK3C2AO00443 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PIK3C2AO00443 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PIK3C2AO00443 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
PIK3C2AO00443 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
PIK3C2AO00443 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PIK3C2AO00443 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PIK3C2AO00443 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PIK3C2AO00443 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PIK3C2AO00443 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PIK3C2AO00443 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PIK3C2AO00443 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PIK3C2AO00443 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
PIK3C2AO00443 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PIK3C2AO00443 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PIK3C2AO00443 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
PIK3C2AO00443 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
PIK3C2AO00443 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
PIK3C2AO00443 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
PIK3C2AO00443 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
PIK3C2AO00443 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
PIK3C2AO00443 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
PIK3C2AO00443 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms