Protein–RNA interactions for Protein: B4DEV8

Proteasome subunit alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DEV8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
B4DEV8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
B4DEV8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
B4DEV8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
B4DEV8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
B4DEV8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
B4DEV8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
B4DEV8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
B4DEV8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
B4DEV8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
B4DEV8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
B4DEV8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
B4DEV8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
B4DEV8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
B4DEV8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
B4DEV8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
B4DEV8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
B4DEV8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
B4DEV8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
B4DEV8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
B4DEV8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
B4DEV8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
B4DEV8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
B4DEV8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
B4DEV8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
B4DEV8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
B4DEV8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
B4DEV8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
B4DEV8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
B4DEV8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
B4DEV8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
B4DEV8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
B4DEV8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
B4DEV8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
B4DEV8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
B4DEV8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
B4DEV8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
B4DEV8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
B4DEV8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
B4DEV8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
B4DEV8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
B4DEV8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
B4DEV8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
B4DEV8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
B4DEV8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
B4DEV8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
B4DEV8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
B4DEV8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
B4DEV8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
B4DEV8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
B4DEV8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
B4DEV8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
B4DEV8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
B4DEV8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
B4DEV8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
B4DEV8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
B4DEV8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
B4DEV8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
B4DEV8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
B4DEV8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
B4DEV8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
B4DEV8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
B4DEV8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
B4DEV8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
B4DEV8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
B4DEV8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
B4DEV8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
B4DEV8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
B4DEV8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
B4DEV8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
B4DEV8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
B4DEV8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
B4DEV8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
B4DEV8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
B4DEV8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
B4DEV8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
B4DEV8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
B4DEV8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
B4DEV8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
B4DEV8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
B4DEV8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
B4DEV8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
B4DEV8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
B4DEV8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
B4DEV8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
B4DEV8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
B4DEV8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
B4DEV8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
B4DEV8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
B4DEV8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
B4DEV8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
B4DEV8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
B4DEV8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
B4DEV8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
B4DEV8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
B4DEV8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
B4DEV8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
B4DEV8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
B4DEV8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
B4DEV8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms