Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF839A8K0R7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF839A8K0R7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF839A8K0R7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF839A8K0R7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF839A8K0R7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF839A8K0R7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF839A8K0R7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF839A8K0R7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF839A8K0R7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF839A8K0R7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF839A8K0R7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF839A8K0R7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF839A8K0R7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF839A8K0R7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF839A8K0R7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF839A8K0R7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF839A8K0R7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF839A8K0R7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF839A8K0R7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF839A8K0R7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF839A8K0R7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF839A8K0R7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF839A8K0R7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF839A8K0R7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF839A8K0R7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF839A8K0R7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF839A8K0R7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF839A8K0R7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF839A8K0R7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF839A8K0R7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF839A8K0R7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF839A8K0R7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF839A8K0R7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF839A8K0R7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF839A8K0R7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF839A8K0R7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF839A8K0R7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF839A8K0R7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF839A8K0R7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF839A8K0R7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF839A8K0R7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF839A8K0R7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF839A8K0R7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF839A8K0R7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF839A8K0R7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF839A8K0R7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF839A8K0R7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF839A8K0R7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF839A8K0R7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF839A8K0R7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF839A8K0R7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF839A8K0R7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF839A8K0R7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF839A8K0R7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF839A8K0R7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF839A8K0R7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF839A8K0R7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF839A8K0R7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF839A8K0R7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF839A8K0R7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF839A8K0R7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF839A8K0R7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF839A8K0R7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF839A8K0R7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF839A8K0R7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF839A8K0R7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF839A8K0R7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF839A8K0R7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF839A8K0R7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF839A8K0R7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF839A8K0R7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF839A8K0R7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF839A8K0R7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF839A8K0R7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF839A8K0R7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF839A8K0R7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF839A8K0R7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF839A8K0R7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF839A8K0R7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF839A8K0R7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF839A8K0R7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF839A8K0R7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF839A8K0R7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF839A8K0R7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF839A8K0R7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF839A8K0R7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF839A8K0R7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF839A8K0R7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF839A8K0R7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZNF839A8K0R7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF839A8K0R7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF839A8K0R7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF839A8K0R7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF839A8K0R7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF839A8K0R7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF839A8K0R7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF839A8K0R7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF839A8K0R7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF839A8K0R7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms