Protein–RNA interactions for Protein: A5PLN7

FAM149A, Protein FAM149A, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM149AA5PLN7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FAM149AA5PLN7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM149AA5PLN7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM149AA5PLN7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM149AA5PLN7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM149AA5PLN7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM149AA5PLN7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM149AA5PLN7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM149AA5PLN7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM149AA5PLN7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM149AA5PLN7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM149AA5PLN7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM149AA5PLN7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM149AA5PLN7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM149AA5PLN7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM149AA5PLN7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM149AA5PLN7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM149AA5PLN7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM149AA5PLN7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM149AA5PLN7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM149AA5PLN7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM149AA5PLN7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM149AA5PLN7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM149AA5PLN7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM149AA5PLN7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM149AA5PLN7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM149AA5PLN7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM149AA5PLN7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM149AA5PLN7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM149AA5PLN7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM149AA5PLN7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM149AA5PLN7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM149AA5PLN7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM149AA5PLN7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM149AA5PLN7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM149AA5PLN7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM149AA5PLN7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM149AA5PLN7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM149AA5PLN7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM149AA5PLN7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM149AA5PLN7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM149AA5PLN7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM149AA5PLN7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM149AA5PLN7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM149AA5PLN7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM149AA5PLN7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
FAM149AA5PLN7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM149AA5PLN7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM149AA5PLN7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM149AA5PLN7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM149AA5PLN7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM149AA5PLN7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM149AA5PLN7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM149AA5PLN7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM149AA5PLN7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM149AA5PLN7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM149AA5PLN7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM149AA5PLN7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM149AA5PLN7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM149AA5PLN7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM149AA5PLN7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM149AA5PLN7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM149AA5PLN7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM149AA5PLN7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM149AA5PLN7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM149AA5PLN7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM149AA5PLN7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM149AA5PLN7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM149AA5PLN7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM149AA5PLN7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM149AA5PLN7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM149AA5PLN7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM149AA5PLN7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM149AA5PLN7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM149AA5PLN7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM149AA5PLN7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM149AA5PLN7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM149AA5PLN7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM149AA5PLN7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM149AA5PLN7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM149AA5PLN7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM149AA5PLN7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM149AA5PLN7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM149AA5PLN7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM149AA5PLN7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM149AA5PLN7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM149AA5PLN7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM149AA5PLN7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM149AA5PLN7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM149AA5PLN7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM149AA5PLN7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM149AA5PLN7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM149AA5PLN7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM149AA5PLN7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM149AA5PLN7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM149AA5PLN7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM149AA5PLN7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM149AA5PLN7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM149AA5PLN7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM149AA5PLN7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms