Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPDC1A2A3K4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPDC1A2A3K4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPDC1A2A3K4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPDC1A2A3K4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPDC1A2A3K4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPDC1A2A3K4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
PTPDC1A2A3K4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.12
PTPDC1A2A3K4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPDC1A2A3K4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPDC1A2A3K4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPDC1A2A3K4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPDC1A2A3K4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPDC1A2A3K4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPDC1A2A3K4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPDC1A2A3K4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPDC1A2A3K4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPDC1A2A3K4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPDC1A2A3K4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPDC1A2A3K4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPDC1A2A3K4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPDC1A2A3K4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPDC1A2A3K4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPDC1A2A3K4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPDC1A2A3K4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPDC1A2A3K4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPDC1A2A3K4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPDC1A2A3K4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPDC1A2A3K4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPDC1A2A3K4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPDC1A2A3K4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPDC1A2A3K4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPDC1A2A3K4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPDC1A2A3K4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPDC1A2A3K4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPDC1A2A3K4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPDC1A2A3K4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPDC1A2A3K4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPDC1A2A3K4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPDC1A2A3K4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPDC1A2A3K4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPDC1A2A3K4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPDC1A2A3K4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPDC1A2A3K4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPDC1A2A3K4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPDC1A2A3K4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPDC1A2A3K4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPDC1A2A3K4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPDC1A2A3K4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPDC1A2A3K4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPDC1A2A3K4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPDC1A2A3K4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPDC1A2A3K4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPDC1A2A3K4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPDC1A2A3K4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPDC1A2A3K4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPDC1A2A3K4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPDC1A2A3K4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPDC1A2A3K4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPDC1A2A3K4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPDC1A2A3K4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPDC1A2A3K4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPDC1A2A3K4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPDC1A2A3K4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPDC1A2A3K4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPDC1A2A3K4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPDC1A2A3K4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPDC1A2A3K4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPDC1A2A3K4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPDC1A2A3K4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPDC1A2A3K4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPDC1A2A3K4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPDC1A2A3K4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPDC1A2A3K4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPDC1A2A3K4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPDC1A2A3K4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPDC1A2A3K4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPDC1A2A3K4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPDC1A2A3K4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPDC1A2A3K4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPDC1A2A3K4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPDC1A2A3K4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPDC1A2A3K4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPDC1A2A3K4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPDC1A2A3K4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTPDC1A2A3K4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTPDC1A2A3K4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTPDC1A2A3K4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTPDC1A2A3K4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPDC1A2A3K4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPDC1A2A3K4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPDC1A2A3K4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPDC1A2A3K4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPDC1A2A3K4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPDC1A2A3K4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPDC1A2A3K4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPDC1A2A3K4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPDC1A2A3K4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPDC1A2A3K4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPDC1A2A3K4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms