Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.091e-6■■■■■ 140.4
UTP3Q9NQZ2 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.111e-6■■■■■ 140.4
UTP3Q9NQZ2 FAM102A-203ENST00000373095 4144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.215e-7■■■■■ 140.4
UTP3Q9NQZ2 SLCO2B1-207ENST00000526660 582 ntTSL 315.56■□□□□ 0.081e-6■■■■■ 140.4
UTP3Q9NQZ2 SLCO2B1-215ENST00000531713 578 ntTSL 39.19□□□□□ -0.941e-6■■■■■ 140.4
UTP3Q9NQZ2 AL136295.5-201ENST00000558468 4798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.315e-10■■■■■ 140.4
UTP3Q9NQZ2 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.888e-7■■■■■ 140.3
UTP3Q9NQZ2 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.548e-7■■■■■ 140.3
UTP3Q9NQZ2 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.548e-7■■■■■ 140.3
UTP3Q9NQZ2 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.278e-7■■■■■ 140.3
UTP3Q9NQZ2 CHMP4A-207ENST00000533523 1266 ntTSL 1 (best)16.56■□□□□ 0.248e-7■■■■■ 140.3
UTP3Q9NQZ2 CBFA2T3-211ENST00000570046 284 ntTSL 310.37□□□□□ -0.757e-7■■■■■ 140.2
UTP3Q9NQZ2 ATP8B2-202ENST00000368489 5861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.193e-6■■■■■ 140.2
UTP3Q9NQZ2 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.042e-6■■■■■ 140.2
UTP3Q9NQZ2 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.682e-6■■■■■ 140.2
UTP3Q9NQZ2 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.622e-6■■■■■ 140.2
UTP3Q9NQZ2 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.432e-6■■■■■ 140.2
UTP3Q9NQZ2 MTA1-210ENST00000481012 987 ntTSL 517.6■□□□□ 0.414e-7■■■■■ 140.2
UTP3Q9NQZ2 MRPS5-206ENST00000475895 1672 ntTSL 217.49■□□□□ 0.392e-6■■■■■ 140.2
UTP3Q9NQZ2 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.342e-6■■■■■ 140.2
UTP3Q9NQZ2 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.332e-6■■■■■ 140.2
UTP3Q9NQZ2 PER1-212ENST00000581395 3209 ntTSL 217.13■□□□□ 0.333e-6■■■■■ 140.2
UTP3Q9NQZ2 UBXN11-213ENST00000472155 2646 ntTSL 1 (best)16.46■□□□□ 0.232e-6■■■■■ 140.2
UTP3Q9NQZ2 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.22e-6■■■■■ 140.2
UTP3Q9NQZ2 MTA1-204ENST00000424723 904 ntTSL 1 (best)16.18■□□□□ 0.184e-7■■■■■ 140.2
UTP3Q9NQZ2 UBXN11-216ENST00000496466 2339 ntTSL 216.08■□□□□ 0.172e-6■■■■■ 140.2
UTP3Q9NQZ2 UBXN11-215ENST00000494942 2325 ntTSL 215.91■□□□□ 0.142e-6■■■■■ 140.2
UTP3Q9NQZ2 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.132e-6■■■■■ 140.2
UTP3Q9NQZ2 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.12e-6■■■■■ 140.2
UTP3Q9NQZ2 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.052e-6■■■■■ 140.2
UTP3Q9NQZ2 UBXN11-214ENST00000475591 2542 ntTSL 1 (best)15.35■□□□□ 0.052e-6■■■■■ 140.2
UTP3Q9NQZ2 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.032e-6■■■■■ 140.2
UTP3Q9NQZ2 ELOVL7-204ENST00000507047 730 ntTSL 215.01□□□□□ -0.012e-6■■■■■ 140.2
UTP3Q9NQZ2 ELOVL7-207ENST00000514809 595 ntTSL 314.98□□□□□ -0.012e-6■■■■■ 140.2
UTP3Q9NQZ2 ELOVL7-201ENST00000425382 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.292e-6■■■■■ 140.2
UTP3Q9NQZ2 MRPS5-202ENST00000345084 1359 ntTSL 212.74□□□□□ -0.372e-6■■■■■ 140.2
UTP3Q9NQZ2 AIMP1-201ENST00000358008 2412 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.642e-6■■■■■ 140.2
UTP3Q9NQZ2 BBS2-209ENST00000564459 641 ntTSL 310.67□□□□□ -0.72e-6■■■■■ 140.2
UTP3Q9NQZ2 BBS2-211ENST00000565781 6073 ntTSL 1 (best)9.18□□□□□ -0.942e-6■■■■■ 140.2
UTP3Q9NQZ2 AIMP1-203ENST00000442366 2519 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.112e-6■■■■■ 140.2
UTP3Q9NQZ2 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.252e-6■■■■■ 140.2
UTP3Q9NQZ2 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.472e-6■■■■■ 140.2
UTP3Q9NQZ2 BBS2-207ENST00000562813 4026 ntTSL 25.46□□□□□ -1.542e-6■■■■■ 140.2
UTP3Q9NQZ2 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.895e-8■■■■■ 140.2
UTP3Q9NQZ2 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.061e-6■■■■■ 140.1
UTP3Q9NQZ2 HERC4-202ENST00000373700 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.011e-6■■■■■ 140.1
UTP3Q9NQZ2 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.381e-6■■■■■ 140.1
UTP3Q9NQZ2 HERC4-209ENST00000473533 3593 ntTSL 1 (best)6.39□□□□□ -1.391e-6■■■■■ 140.1
UTP3Q9NQZ2 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.531e-6■■■■■ 140.1
UTP3Q9NQZ2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.453e-8■■■■■ 140
UTP3Q9NQZ2 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.959e-7■■■■■ 140
UTP3Q9NQZ2 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.789e-7■■■■■ 140
UTP3Q9NQZ2 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.089e-7■■■■■ 140
UTP3Q9NQZ2 ATXN7L1-202ENST00000419735 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.61e-6■■■■■ 140
UTP3Q9NQZ2 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.921e-6■■■■■ 140
UTP3Q9NQZ2 SNRPG-203ENST00000429728 566 ntTSL 29.66□□□□□ -0.863e-7■■■■■ 140
UTP3Q9NQZ2 SNRPG-201ENST00000272348 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.973e-7■■■■■ 140
UTP3Q9NQZ2 POLA1-202ENST00000379068 5486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.942e-6■■■■■ 140
UTP3Q9NQZ2 POLA1-201ENST00000379059 5440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.062e-6■■■■■ 140
UTP3Q9NQZ2 POLA1-206ENST00000611764 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.062e-6■■■■■ 140
UTP3Q9NQZ2 GGA2-204ENST00000563047 366 ntTSL 522.36■■□□□ 1.173e-8■■■■■ 139.9
UTP3Q9NQZ2 GGA2-202ENST00000562117 387 ntTSL 514.1□□□□□ -0.153e-8■■■■■ 139.9
UTP3Q9NQZ2 INTS1-202ENST00000468115 3051 ntTSL 215.12■□□□□ 0.011e-6■■■■■ 139.9
UTP3Q9NQZ2 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.971e-6■■■■■ 139.9
UTP3Q9NQZ2 CORO7-211ENST00000572044 563 ntTSL 420.53■□□□□ 0.881e-6■■■■■ 139.8
UTP3Q9NQZ2 CORO7-216ENST00000572549 663 ntTSL 518.61■□□□□ 0.571e-6■■■■■ 139.8
UTP3Q9NQZ2 VWDE-203ENST00000452576 5936 ntTSL 1 (best)14.99□□□□□ -0.011e-8■■■■■ 139.8
UTP3Q9NQZ2 VWDE-201ENST00000275358 5260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.091e-8■■■■■ 139.8
UTP3Q9NQZ2 VWDE-206ENST00000614403 4701 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.341e-8■■■■■ 139.8
UTP3Q9NQZ2 VWDE-205ENST00000521169 4700 ntTSL 512.92□□□□□ -0.341e-8■■■■■ 139.8
UTP3Q9NQZ2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.322e-7■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 GLT8D1-210ENST00000484163 1889 ntTSL 528.4■■■□□ 2.142e-7■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.991e-15■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 ST7L-219ENST00000480988 1857 ntTSL 227.08■■□□□ 1.932e-7■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 ST7L-225ENST00000497235 859 ntTSL 326.79■■□□□ 1.882e-7■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.852e-7■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 LAPTM4B-202ENST00000517924 618 ntTSL 526.32■■□□□ 1.81e-15■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 ST7L-212ENST00000467335 990 ntTSL 324.32■■□□□ 1.482e-7■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 ST7L-215ENST00000473206 821 ntTSL 224.32■■□□□ 1.482e-7■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.42e-7■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.372e-7■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.342e-24■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.342e-7■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 ST7L-226ENST00000497457 1582 ntTSL 1 (best)23.18■■□□□ 1.32e-7■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 ST7L-214ENST00000470683 752 ntTSL 222.82■■□□□ 1.242e-7■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.22e-24■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.152e-7■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.145e-7■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 ST7L-228ENST00000498383 685 ntTSL 221.95■■□□□ 1.12e-7■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 ST7L-216ENST00000477332 848 ntTSL 321.95■■□□□ 1.12e-7■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 HEXDC-207ENST00000578775 779 ntTSL 321.86■■□□□ 1.092e-7■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.72■■□□□ 1.072e-7■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 TFDP2-207ENST00000475734 578 ntTSL 521.72■■□□□ 1.074e-8■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.062e-7■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.052e-7■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 CENPT-226ENST00000568069 507 ntTSL 421.36■■□□□ 1.012e-7■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.971e-15■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 TATDN1-216ENST00000523152 692 ntTSL 520.96■□□□□ 0.952e-7■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 TFDP2-208ENST00000476617 596 ntTSL 420.93■□□□□ 0.944e-8■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.892e-7■■■■■ 139.7
Retrieved 100 of 52,753 protein–RNA pairs in 1079 ms