RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358008.7

AIMP1-201, Transcript of aminoacyl tRNA synthetase complex interacting multifunctional protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene AIMP1, Length 2,412 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIMP1-201ENST00000358008 NISCHQ9Y2I1 1504 aa20.92■□□□□ 0.94
AIMP1-201ENST00000358008 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa17.95■□□□□ 0.46
AIMP1-201ENST00000358008 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa17.77■□□□□ 0.44
AIMP1-201ENST00000358008 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
AIMP1-201ENST00000358008 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP17.67■□□□□ 0.42
AIMP1-201ENST00000358008 DCAF8L2P0C7V8 631 aa17.38■□□□□ 0.37
AIMP1-201ENST00000358008 CHIC1Q5VXU3 224 aa17.22■□□□□ 0.35
AIMP1-201ENST00000358008 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa17.17■□□□□ 0.34
AIMP1-201ENST00000358008 MYO15BQ96JP2 1530 aa17.15■□□□□ 0.34
AIMP1-201ENST00000358008 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
AIMP1-201ENST00000358008 HRCP23327 699 aa16.92■□□□□ 0.3
AIMP1-201ENST00000358008 PCGF6Q9BYE7 350 aa16.82■□□□□ 0.28
AIMP1-201ENST00000358008 ABCC9O60706 1549 aa16.74■□□□□ 0.27
AIMP1-201ENST00000358008 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa16.72■□□□□ 0.27
AIMP1-201ENST00000358008 SCRIBQ14160 1630 aa16.65■□□□□ 0.26
AIMP1-201ENST00000358008 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
AIMP1-201ENST00000358008 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
AIMP1-201ENST00000358008 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
AIMP1-201ENST00000358008 NACADO15069 1562 aa16.48■□□□□ 0.23
AIMP1-201ENST00000358008 TRIM41Q8WV44 630 aa16.46■□□□□ 0.23
AIMP1-201ENST00000358008 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa16.45■□□□□ 0.22
AIMP1-201ENST00000358008 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
AIMP1-201ENST00000358008 CECR2Q9BXF3 1484 aa16.31■□□□□ 0.2
AIMP1-201ENST00000358008 MROH2BQ7Z745 1585 aa16.27■□□□□ 0.19
AIMP1-201ENST00000358008 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
AIMP1-201ENST00000358008 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
AIMP1-201ENST00000358008 WIZO95785 1651 aa16.18■□□□□ 0.18
AIMP1-201ENST00000358008 EHMT2Q96KQ7 1210 aa16.18■□□□□ 0.18
AIMP1-201ENST00000358008 UNC13AQ9UPW8 1703 aa16.14■□□□□ 0.17
AIMP1-201ENST00000358008 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
AIMP1-201ENST00000358008 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
AIMP1-201ENST00000358008 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
AIMP1-201ENST00000358008 BICRAQ9NZM4 1560 aa15.92■□□□□ 0.14
AIMP1-201ENST00000358008 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
AIMP1-201ENST00000358008 SMARCA4P51532 1647 aa15.91■□□□□ 0.14
AIMP1-201ENST00000358008 CCDC88BA6NC98 1476 aa15.89■□□□□ 0.13
AIMP1-201ENST00000358008 ABCC8Q09428 1581 aa15.87■□□□□ 0.13
AIMP1-201ENST00000358008 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP15.85■□□□□ 0.13
AIMP1-201ENST00000358008 SMARCA2P51531 1590 aa15.85■□□□□ 0.13
AIMP1-201ENST00000358008 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
AIMP1-201ENST00000358008 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
AIMP1-201ENST00000358008 SOGA1O94964 1423 aa15.76■□□□□ 0.11
AIMP1-201ENST00000358008 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP15.76■□□□□ 0.11
AIMP1-201ENST00000358008 CEP162Q5TB80 1403 aa15.75■□□□□ 0.11
AIMP1-201ENST00000358008 TNIKQ9UKE5 1360 aa15.72■□□□□ 0.11
AIMP1-201ENST00000358008 EEA1Q15075 1411 aa15.72■□□□□ 0.11
AIMP1-201ENST00000358008 CSRNP3Q8WYN3 585 aa15.7■□□□□ 0.1
AIMP1-201ENST00000358008 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP15.69■□□□□ 0.1
AIMP1-201ENST00000358008 UBTFP17480 764 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
AIMP1-201ENST00000358008 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa15.66■□□□□ 0.1
AIMP1-201ENST00000358008 MYT1Q01538 1121 aa15.61■□□□□ 0.09
AIMP1-201ENST00000358008 GOLGA3Q08378 1498 aa15.61■□□□□ 0.09
AIMP1-201ENST00000358008 PEG3Q9GZU2 1588 aa15.59■□□□□ 0.09
AIMP1-201ENST00000358008 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
AIMP1-201ENST00000358008 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
AIMP1-201ENST00000358008 CEP164Q9UPV0 1460 aa15.51■□□□□ 0.07
AIMP1-201ENST00000358008 SYNJ1O43426 1573 aa15.51■□□□□ 0.07
AIMP1-201ENST00000358008 NEUROD1Q13562 356 aa15.5■□□□□ 0.07
AIMP1-201ENST00000358008 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa15.48■□□□□ 0.07
AIMP1-201ENST00000358008 KIF21BO75037 1637 aa15.47■□□□□ 0.07
AIMP1-201ENST00000358008 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
AIMP1-201ENST00000358008 CLIP1P30622 1438 aa15.44■□□□□ 0.06
AIMP1-201ENST00000358008 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
AIMP1-201ENST00000358008 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa15.39■□□□□ 0.05
AIMP1-201ENST00000358008 VPS8Q8N3P4 1428 aa15.38■□□□□ 0.05
AIMP1-201ENST00000358008 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
AIMP1-201ENST00000358008 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
AIMP1-201ENST00000358008 APLP2Q06481 763 aa15.37■□□□□ 0.05
AIMP1-201ENST00000358008 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa15.37■□□□□ 0.05
AIMP1-201ENST00000358008 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.04
AIMP1-201ENST00000358008 TOP2BQ02880 1626 aa15.31■□□□□ 0.04
AIMP1-201ENST00000358008 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa15.24■□□□□ 0.03
AIMP1-201ENST00000358008 HMGXB3Q12766 1538 aa15.23■□□□□ 0.03
AIMP1-201ENST00000358008 NCAPD3P42695 1498 aa15.22■□□□□ 0.03
AIMP1-201ENST00000358008 ERICH3Q5RHP9 1530 aa15.21■□□□□ 0.03
AIMP1-201ENST00000358008 PRXQ9BXM0 1461 aa15.2■□□□□ 0.02
AIMP1-201ENST00000358008 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
AIMP1-201ENST00000358008 MIER1Q8N108 512 aa15.16■□□□□ 0.02
AIMP1-201ENST00000358008 ARAP1Q96P48 1450 aa15.16■□□□□ 0.02
AIMP1-201ENST00000358008 CUX1P39880 1505 aa15.14■□□□□ 0.01
AIMP1-201ENST00000358008 KIF27Q86VH2 1401 aa15.13■□□□□ 0.01
AIMP1-201ENST00000358008 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa15.12■□□□□ 0.01
AIMP1-201ENST00000358008 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
AIMP1-201ENST00000358008 CLSPNQ9HAW4 1339 aa15.11■□□□□ 0.01
AIMP1-201ENST00000358008 CFTRP13569 1480 aa15.08■□□□□ 0
AIMP1-201ENST00000358008 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
AIMP1-201ENST00000358008 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
AIMP1-201ENST00000358008 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa15.01□□□□□ -0.01
AIMP1-201ENST00000358008 CCNB3Q8WWL7 1395 aa14.98□□□□□ -0.01
AIMP1-201ENST00000358008 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
AIMP1-201ENST00000358008 CUX2O14529 1486 aa14.95□□□□□ -0.02
AIMP1-201ENST00000358008 IGF1RP08069 1367 aa14.94□□□□□ -0.02
AIMP1-201ENST00000358008 PRDM2Q13029 1718 aa14.94□□□□□ -0.02
AIMP1-201ENST00000358008 ITGAEP38570 1179 aa14.94□□□□□ -0.02
AIMP1-201ENST00000358008 CADPSQ9ULU8 1353 aa14.9□□□□□ -0.02
AIMP1-201ENST00000358008 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa14.89□□□□□ -0.03
AIMP1-201ENST00000358008 TIAM1Q13009 1591 aa14.87□□□□□ -0.03
AIMP1-201ENST00000358008 MAP3K1Q13233 1512 aa14.87□□□□□ -0.03
AIMP1-201ENST00000358008 FGD5Q6ZNL6 1462 aa14.86□□□□□ -0.03
AIMP1-201ENST00000358008 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms