Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP6AP1Q15904 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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