Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 NDUFS3-211ENST00000533507 1769 ntTSL 230.46■■■□□ 2.471e-6■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 FAR1-201ENST00000354817 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.528e-8■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 EIF4A2-201ENST00000323963 1919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.628e-8■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 EIF4A2-203ENST00000426808 1751 ntTSL 1 (best)8.25□□□□□ -1.098e-8■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 EIF4A2-207ENST00000443963 1729 ntTSL 1 (best)8.17□□□□□ -1.18e-8■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 EIF4A2-205ENST00000440191 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.168e-8■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 RPL26-202ENST00000578069 456 ntTSL 26.83□□□□□ -1.328e-8■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 RPL26-211ENST00000584441 328 ntTSL 36.52□□□□□ -1.378e-8■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 EIF4A2-202ENST00000425053 1977 ntTSL 56.33□□□□□ -1.48e-8■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 EIF4A2-219ENST00000485101 5327 ntTSL 54.66□□□□□ -1.668e-8■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.958e-8■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.347e-7■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 ERGIC3-202ENST00000348547 1359 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.057e-7■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 ERGIC3-220ENST00000640748 832 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.157e-7■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 ISYNA1-204ENST00000577916 2148 ntTSL 526.7■■□□□ 1.866e-8■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 ISYNA1-211ENST00000582811 2039 ntTSL 223.79■■□□□ 1.46e-8■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.226e-8■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.066e-8■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 ISYNA1-210ENST00000582770 1654 ntTSL 219.84■□□□□ 0.776e-8■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.776e-8■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.652e-25■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.532e-25■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.372e-25■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 STMN1-206ENST00000455785 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.032e-25■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 STMN1-207ENST00000465604 2947 ntTSL 1 (best)4.7□□□□□ -1.662e-25■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.079e-12■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.819e-12■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.699e-12■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.59e-12■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.789e-12■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 PNKP-223ENST00000629179 811 ntTSL 417.03■□□□□ 0.329e-12■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.289e-12■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.481e-6■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 TPI1-207ENST00000493987 839 ntTSL 312.69□□□□□ -0.381e-6■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 25e-9■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.675e-9■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.575e-9■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.595e-9■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 PKM-222ENST00000568883 1863 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.185e-9■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 PKM-202ENST00000335181 2318 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.275e-9■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 HOXB7-203ENST00000567101 528 ntTSL 212.86□□□□□ -0.351e-7■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 H3F3B-212ENST00000592643 795 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.172e-12■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 HMGB1-202ENST00000339872 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.024e-8■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 HMGB1-206ENST00000405805 4199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.314e-8■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 HMGB1-203ENST00000341423 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.764e-8■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.945e-7■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 RAVER1-204ENST00000592208 4693 ntTSL 1 (best)16.3■□□□□ 0.25e-7■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.025e-7■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 RAVER1-201ENST00000293677 3595 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.245e-7■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 RAVER1-208ENST00000617231 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.445e-7■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 ERCC1-210ENST00000589381 738 ntTSL 521.82■■□□□ 1.083e-6■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.73e-6■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 HM13-221ENST00000493364 372 ntTSL 212.6□□□□□ -0.391e-9■■□□□ 13.7
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PABPC4Q13310 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.44e-6■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.674e-6■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 KIAA0100-202ENST00000528896 7407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.582e-11■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.892e-7■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.261e-7■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 NOL7-203ENST00000474485 920 ntTSL 310.98□□□□□ -0.651e-7■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 PDCD11-201ENST00000369797 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.412e-6■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 MAD2L2-208ENST00000445656 678 ntTSL 326.15■■□□□ 1.782e-7■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 MAD2L2-209ENST00000456915 1032 ntTSL 226.05■■□□□ 1.762e-7■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 MAD2L2-203ENST00000376664 858 ntTSL 225.61■■□□□ 1.692e-7■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.938e-21■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.518e-21■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.263e-8■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.013e-8■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.383e-8■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.293e-8■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.243e-8■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.113e-8■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 HM13-212ENST00000469097 801 ntTSL 514.22□□□□□ -0.136e-10■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 RPS7-205ENST00000462576 907 ntTSL 1 (best)32.29■■■□□ 2.767e-9■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 RPS7-202ENST00000403564 764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.047e-9■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 RPS7-201ENST00000304921 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.177e-9■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 PLEKHJ1-209ENST00000588545 889 ntTSL 226.23■■□□□ 1.792e-10■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 BZW2-209ENST00000437745 1711 ntTSL 1 (best)16.22■□□□□ 0.193e-9■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 BZW2-214ENST00000630952 1721 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.323e-9■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 BZW2-207ENST00000433922 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.643e-9■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 BZW2-202ENST00000405202 1689 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.653e-9■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 BZW2-212ENST00000452975 1464 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.693e-9■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 BZW2-201ENST00000258761 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.713e-9■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 BZW2-208ENST00000436868 1784 ntTSL 59.6□□□□□ -0.873e-9■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 TUBB4B-202ENST00000604929 2035 ntTSL 1 (best)21.44■■□□□ 1.021e-13■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.331e-13■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 OAT-208ENST00000539214 1864 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.092e-11■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 OAT-201ENST00000368845 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.222e-11■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 PAXX-204ENST00000481187 794 ntTSL 319.31■□□□□ 0.681e-6■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.51e-8■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.064e-7■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.944e-7■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.374e-7■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.324e-7■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 COPE-208ENST00000598969 1770 ntTSL 524.01■■□□□ 1.431e-6■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.221e-6■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.881e-6■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 EXOSC1-204ENST00000370902 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.249e-7■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 EXOSC1-202ENST00000370885 718 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.299e-7■■□□□ 13.7
PABPC4Q13310 EXOSC1-203ENST00000370886 741 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.49e-7■■□□□ 13.7
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