Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBB4BP68371 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.7 ms