Protein–RNA interactions for Protein: Q99962

SH3GL2, Endophilin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL2Q99962 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3GL2Q99962 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms