Protein–RNA interactions for Protein: Q99962

SH3GL2, Endophilin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL2Q99962 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC35.07■■■■□ 3.2
SH3GL2Q99962 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
SH3GL2Q99962 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SH3GL2Q99962 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SH3GL2Q99962 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SH3GL2Q99962 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SH3GL2Q99962 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SH3GL2Q99962 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SH3GL2Q99962 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SH3GL2Q99962 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
SH3GL2Q99962 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
SH3GL2Q99962 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
SH3GL2Q99962 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SH3GL2Q99962 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.96■■■□□ 2.87
SH3GL2Q99962 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
SH3GL2Q99962 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
SH3GL2Q99962 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SH3GL2Q99962 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SH3GL2Q99962 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
SH3GL2Q99962 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
SH3GL2Q99962 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SH3GL2Q99962 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
SH3GL2Q99962 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
SH3GL2Q99962 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
SH3GL2Q99962 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
SH3GL2Q99962 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
SH3GL2Q99962 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
SH3GL2Q99962 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SH3GL2Q99962 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SH3GL2Q99962 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
SH3GL2Q99962 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
SH3GL2Q99962 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SH3GL2Q99962 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
SH3GL2Q99962 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SH3GL2Q99962 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SH3GL2Q99962 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
SH3GL2Q99962 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SH3GL2Q99962 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SH3GL2Q99962 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
SH3GL2Q99962 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SH3GL2Q99962 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SH3GL2Q99962 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SH3GL2Q99962 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SH3GL2Q99962 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SH3GL2Q99962 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SH3GL2Q99962 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
SH3GL2Q99962 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SH3GL2Q99962 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SH3GL2Q99962 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SH3GL2Q99962 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SH3GL2Q99962 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SH3GL2Q99962 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SH3GL2Q99962 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
SH3GL2Q99962 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SH3GL2Q99962 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SH3GL2Q99962 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SH3GL2Q99962 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SH3GL2Q99962 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SH3GL2Q99962 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SH3GL2Q99962 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SH3GL2Q99962 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
SH3GL2Q99962 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SH3GL2Q99962 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SH3GL2Q99962 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SH3GL2Q99962 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SH3GL2Q99962 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SH3GL2Q99962 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SH3GL2Q99962 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SH3GL2Q99962 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SH3GL2Q99962 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SH3GL2Q99962 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SH3GL2Q99962 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SH3GL2Q99962 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SH3GL2Q99962 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SH3GL2Q99962 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SH3GL2Q99962 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SH3GL2Q99962 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SH3GL2Q99962 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SH3GL2Q99962 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SH3GL2Q99962 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
SH3GL2Q99962 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SH3GL2Q99962 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SH3GL2Q99962 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SH3GL2Q99962 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SH3GL2Q99962 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SH3GL2Q99962 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SH3GL2Q99962 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SH3GL2Q99962 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SH3GL2Q99962 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SH3GL2Q99962 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SH3GL2Q99962 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SH3GL2Q99962 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SH3GL2Q99962 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
SH3GL2Q99962 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
SH3GL2Q99962 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SH3GL2Q99962 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SH3GL2Q99962 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SH3GL2Q99962 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SH3GL2Q99962 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SH3GL2Q99962 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms