Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX29P2Q8IUI4 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX29P2Q8IUI4 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX29P2Q8IUI4 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX29P2Q8IUI4 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX29P2Q8IUI4 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX29P2Q8IUI4 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX29P2Q8IUI4 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX29P2Q8IUI4 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX29P2Q8IUI4 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX29P2Q8IUI4 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX29P2Q8IUI4 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX29P2Q8IUI4 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX29P2Q8IUI4 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX29P2Q8IUI4 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX29P2Q8IUI4 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX29P2Q8IUI4 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX29P2Q8IUI4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX29P2Q8IUI4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX29P2Q8IUI4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX29P2Q8IUI4 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX29P2Q8IUI4 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX29P2Q8IUI4 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX29P2Q8IUI4 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX29P2Q8IUI4 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX29P2Q8IUI4 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX29P2Q8IUI4 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms