Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Q1T7F1 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Q1T7F1 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Q1T7F1 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Q1T7F1 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Q1T7F1 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Q1T7F1 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Q1T7F1 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Q1T7F1 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Q1T7F1 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Q1T7F1 ARAF-203ENST00000377045 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Q1T7F1 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Q1T7F1 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Q1T7F1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Q1T7F1 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Q1T7F1 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Q1T7F1 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Q1T7F1 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Q1T7F1 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Q1T7F1 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Q1T7F1 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Q1T7F1 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Q1T7F1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Q1T7F1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Q1T7F1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Q1T7F1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Q1T7F1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Q1T7F1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Q1T7F1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Q1T7F1 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Q1T7F1 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Q1T7F1 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Q1T7F1 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Q1T7F1 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Q1T7F1 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Q1T7F1 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Q1T7F1 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Q1T7F1 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Q1T7F1 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Q1T7F1 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Q1T7F1 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Q1T7F1 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Q1T7F1 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Q1T7F1 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Q1T7F1 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Q1T7F1 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Q1T7F1 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Q1T7F1 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Q1T7F1 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Q1T7F1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Q1T7F1 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Q1T7F1 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Q1T7F1 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Q1T7F1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Q1T7F1 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Q1T7F1 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Q1T7F1 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Q1T7F1 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Q1T7F1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Q1T7F1 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Q1T7F1 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Q1T7F1 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Q1T7F1 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Q1T7F1 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Q1T7F1 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Q1T7F1 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Q1T7F1 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Q1T7F1 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Q1T7F1 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Q1T7F1 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Q1T7F1 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Q1T7F1 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Q1T7F1 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Q1T7F1 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Q1T7F1 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Q1T7F1 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Q1T7F1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Q1T7F1 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Q1T7F1 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Q1T7F1 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Q1T7F1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Q1T7F1 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Q1T7F1 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Q1T7F1 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Q1T7F1 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Q1T7F1 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Q1T7F1 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Q1T7F1 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Q1T7F1 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Q1T7F1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Q1T7F1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Q1T7F1 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Q1T7F1 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Q1T7F1 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Q1T7F1 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Q1T7F1 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Q1T7F1 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Q1T7F1 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Q1T7F1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Q1T7F1 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
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