Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 ASAH1-242ENST00000637014 2626 ntTSL 26.15□□□□□ -1.435e-8■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 MRPS18C-209ENST00000514581 301 ntTSL 24.81□□□□□ -1.645e-8■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 RTN4IP1-203ENST00000498091 433 ntTSL 24.35□□□□□ -1.715e-8■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.792e-11■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 GABARAP-203ENST00000571129 568 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.164e-8■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.48e-13■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 SNHG5-216ENST00000623267 374 ntTSL 56.32□□□□□ -1.48e-13■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.064e-8■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.044e-8■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 LSM14A-206ENST00000588582 3601 ntTSL 211.14□□□□□ -0.634e-8■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 FBXO7-204ENST00000425028 1921 ntTSL 523.08■■□□□ 1.285e-8■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 FBXO7-203ENST00000420700 1900 ntTSL 519.35■□□□□ 0.695e-8■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.675e-8■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 FBXO7-209ENST00000492535 6884 ntTSL 58.63□□□□□ -1.035e-8■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 FBXO7-202ENST00000397426 1888 ntTSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.085e-8■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 VPS4A-201ENST00000254950 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.321e-7■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 FKBP8-205ENST00000596494 439 ntTSL 320.84■□□□□ 0.932e-7■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 TMEM141-205ENST00000484854 567 ntTSL 330.34■■■□□ 2.451e-6■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 UBXN1-209ENST00000528907 861 ntTSL 216.88■□□□□ 0.292e-10■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 UFC1-201ENST00000368003 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.241e-7■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 EIF3G-210ENST00000590158 1034 ntTSL 218.52■□□□□ 0.567e-9■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 TOP1MT-203ENST00000517857 624 ntTSL 217.32■□□□□ 0.364e-8■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 TIMM50-206ENST00000595961 2576 ntTSL 214.51□□□□□ -0.098e-7■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 VCL-202ENST00000372755 6489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.382e-10■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 VCL-201ENST00000211998 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.612e-10■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 VCL-206ENST00000623461 7995 ntTSL 1 (best)9.5□□□□□ -0.892e-10■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 STT3A-211ENST00000529196 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.054e-7■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 STT3A-214ENST00000531491 2160 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.234e-7■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.794e-8■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 DPM2-205ENST00000495270 1662 ntTSL 1 (best)18.75■□□□□ 0.594e-8■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.388e-7■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 PAXX-207ENST00000493968 958 ntTSL 1 (best)23.77■■□□□ 1.45e-7■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 PAXX-205ENST00000483807 705 ntTSL 522.23■■□□□ 1.155e-7■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.895e-7■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 PAXX-208ENST00000498095 1077 ntTSL 519.8■□□□□ 0.765e-7■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.141e-6■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.78e-7■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.478e-7■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.218e-7■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.671e-11■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 LSM8-201ENST00000249299 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.031e-11■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 EIF2A-203ENST00000460851 2198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.672e-6■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 LSM8-204ENST00000424702 4030 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.051e-11■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 EIF2A-202ENST00000406576 1795 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.162e-6■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.622e-6■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 EIF2A-211ENST00000477551 1906 ntTSL 1 (best)3.82□□□□□ -1.82e-6■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.062e-6■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.142e-6■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.12e-6■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 AGRN-203ENST00000461111 3385 ntTSL 1 (best)13.46□□□□□ -0.252e-6■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 ERGIC3-206ENST00000416206 1235 ntTSL 513.91□□□□□ -0.187e-7■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 AP2A1-205ENST00000597774 2196 ntTSL 518.91■□□□□ 0.624e-24■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.142e-7■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 CNDP2-202ENST00000324301 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.32e-7■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 CNDP2-209ENST00000579847 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.372e-7■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 CNDP2-226ENST00000584581 4523 ntTSL 212.2□□□□□ -0.462e-7■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 CNDP2-208ENST00000579624 1176 ntTSL 59.69□□□□□ -0.862e-7■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.964e-30■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 RANBP1-207ENST00000423859 832 ntTSL 322.03■■□□□ 1.121e-30■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 RANBP1-205ENST00000418705 932 ntTSL 320.11■□□□□ 0.811e-30■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.187e-7■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.177e-7■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 TPI1-202ENST00000396705 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.127e-7■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 TPI1-209ENST00000535434 1587 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.337e-7■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 LMAN2-204ENST00000504071 562 ntTSL 221.29■■□□□ 15e-14■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 HAX1-207ENST00000477780 1089 ntTSL 211.97□□□□□ -0.495e-8■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 C19orf48-207ENST00000596655 1639 ntTSL 222.2■■□□□ 1.146e-11■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.816e-11■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 C19orf48-216ENST00000641834 1718 nt19.3■□□□□ 0.686e-11■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.46e-11■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 C19orf48-210ENST00000598463 1844 ntTSL 1 (best)15.2■□□□□ 0.026e-11■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.434e-7■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 RPL23A-205ENST00000472628 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.324e-7■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 RPL23A-202ENST00000394935 580 ntTSL 311.81□□□□□ -0.524e-7■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 RPL23A-203ENST00000394938 688 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.914e-7■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 RPL23A-207ENST00000578181 593 ntTSL 24.06□□□□□ -1.764e-7■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 PSMD11-211ENST00000585265 670 ntTSL 213.98□□□□□ -0.173e-15■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.495e-13■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.035e-13■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 TTLL4-205ENST00000417855 601 ntTSL 33.18□□□□□ -1.94e-17■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.61e-25■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 DARS-209ENST00000478212 892 ntTSL 28.54□□□□□ -1.041e-25■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 SLC25A39-213ENST00000591006 2217 ntTSL 214.79□□□□□ -0.049e-7■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.329e-13■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 SNRPD2-203ENST00000585392 379 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.019e-13■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 SNRPD2-204ENST00000587367 596 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.299e-13■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 SNRPD2-202ENST00000391932 615 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.399e-13■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 SNRPD2-201ENST00000342669 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.439e-13■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 GUK1-231ENST00000485859 325 ntTSL 1 (best)20.69■□□□□ 0.98e-9■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 HNRNPR-209ENST00000476660 1637 ntTSL 1 (best)16.77■□□□□ 0.274e-8■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 HNRNPR-203ENST00000374616 2691 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.284e-8■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 HNRNPR-202ENST00000374612 2694 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.314e-8■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 HNRNPR-201ENST00000302271 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.44e-8■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 EIF3L-208ENST00000451427 583 ntTSL 46.28□□□□□ -1.41e-15■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 IFRD2-210ENST00000474556 1812 ntTSL 518.81■□□□□ 0.62e-6■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 FKBP8-212ENST00000606531 460 ntTSL 217.68■□□□□ 0.425e-7■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 MRPL38-210ENST00000480203 534 ntTSL 310.76□□□□□ -0.691e-7■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 PRDX4-205ENST00000495599 632 ntTSL 320.8■□□□□ 0.924e-7■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 PRDX4-203ENST00000379349 815 ntTSL 314.92□□□□□ -0.024e-7■■□□□ 13.8
PABPC4Q13310 PRDX4-201ENST00000379331 852 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.094e-7■■□□□ 13.8
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