RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485859.1

GUK1-231, Transcript of guanylate kinase 1, human

TSL 1 (best)

Gene GUK1, Length 325 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GUK1-231	ENST00000485859	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		42.46	■■■■■ 4.39
GUK1-231	ENST00000485859	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		37.59	■■■■□ 3.61
GUK1-231	ENST00000485859	ABCC9	O60706	1549 aa		36.6	■■■■□ 3.45
GUK1-231	ENST00000485859	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	35.46	■■■■□ 3.27
GUK1-231	ENST00000485859	NACAD	O15069	1562 aa		35.28	■■■■□ 3.24
GUK1-231	ENST00000485859	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		35.27	■■■■□ 3.24
GUK1-231	ENST00000485859	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		35.25	■■■■□ 3.23
GUK1-231	ENST00000485859	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		35.16	■■■■□ 3.22
GUK1-231	ENST00000485859	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		35.12	■■■■□ 3.21
GUK1-231	ENST00000485859	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		34.52	■■■■□ 3.12
GUK1-231	ENST00000485859	SCRIB	Q14160	1630 aa		34.38	■■■■□ 3.09
GUK1-231	ENST00000485859	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		34.29	■■■■□ 3.08
GUK1-231	ENST00000485859	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	34.25	■■■■□ 3.07
GUK1-231	ENST00000485859	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		33.83	■■■■□ 3.01
GUK1-231	ENST00000485859	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		33.44	■■■□□ 2.94
GUK1-231	ENST00000485859	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	33.31	■■■□□ 2.92
GUK1-231	ENST00000485859	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		33.11	■■■□□ 2.89
GUK1-231	ENST00000485859	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		33.11	■■■□□ 2.89
GUK1-231	ENST00000485859	SMARCA4	P51532	1647 aa		32.9	■■■□□ 2.86
GUK1-231	ENST00000485859	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	32.85	■■■□□ 2.85
GUK1-231	ENST00000485859	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		32.77	■■■□□ 2.84
GUK1-231	ENST00000485859	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		32.67	■■■□□ 2.82
GUK1-231	ENST00000485859	NCAPD3	P42695	1498 aa		32.58	■■■□□ 2.81
GUK1-231	ENST00000485859	SMARCA2	P51531	1590 aa		32.58	■■■□□ 2.81
GUK1-231	ENST00000485859	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		32.58	■■■□□ 2.81
GUK1-231	ENST00000485859	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	32.47	■■■□□ 2.79
GUK1-231	ENST00000485859	HMGXB3	Q12766	1538 aa		32.45	■■■□□ 2.78
GUK1-231	ENST00000485859	WIZ	O95785	1651 aa		32.4	■■■□□ 2.78
GUK1-231	ENST00000485859	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	32.37	■■■□□ 2.77
GUK1-231	ENST00000485859	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	32.06	■■■□□ 2.72
GUK1-231	ENST00000485859	NES	P48681	1621 aa		31.78	■■■□□ 2.68
GUK1-231	ENST00000485859	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	31.76	■■■□□ 2.67
GUK1-231	ENST00000485859	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		31.7	■■■□□ 2.66
GUK1-231	ENST00000485859	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		31.65	■■■□□ 2.66
GUK1-231	ENST00000485859	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		31.64	■■■□□ 2.66
GUK1-231	ENST00000485859	CFTR	P13569	1480 aa		31.52	■■■□□ 2.64
GUK1-231	ENST00000485859	ERCC6	Q03468	1493 aa		31.46	■■■□□ 2.63
GUK1-231	ENST00000485859	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		31.41	■■■□□ 2.62
GUK1-231	ENST00000485859	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		31.38	■■■□□ 2.61
GUK1-231	ENST00000485859	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		31.28	■■■□□ 2.6
GUK1-231	ENST00000485859	PRDM2	Q13029	1718 aa		31.26	■■■□□ 2.59
GUK1-231	ENST00000485859	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	31.24	■■■□□ 2.59
GUK1-231	ENST00000485859	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		31.21	■■■□□ 2.59
GUK1-231	ENST00000485859	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		31.13	■■■□□ 2.57
GUK1-231	ENST00000485859	CUX2	O14529	1486 aa		31.05	■■■□□ 2.56
GUK1-231	ENST00000485859	WDR62	O43379	1518 aa		31.03	■■■□□ 2.56
GUK1-231	ENST00000485859	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	31.01	■■■□□ 2.55
GUK1-231	ENST00000485859	TOPBP1	Q92547	1522 aa		30.83	■■■□□ 2.53
GUK1-231	ENST00000485859	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		30.8	■■■□□ 2.52
GUK1-231	ENST00000485859	ABCC8	Q09428	1581 aa		30.74	■■■□□ 2.51
GUK1-231	ENST00000485859	CUX1	P39880	1505 aa		30.73	■■■□□ 2.51
GUK1-231	ENST00000485859	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	30.6	■■■□□ 2.49
GUK1-231	ENST00000485859	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	30.56	■■■□□ 2.48
GUK1-231	ENST00000485859	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		30.56	■■■□□ 2.48
GUK1-231	ENST00000485859	IFT140	Q96RY7	1462 aa		30.54	■■■□□ 2.48
GUK1-231	ENST00000485859	SYNJ1	O43426	1573 aa		30.54	■■■□□ 2.48
GUK1-231	ENST00000485859	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	30.49	■■■□□ 2.47
GUK1-231	ENST00000485859	TOP2B	Q02880	1626 aa		30.48	■■■□□ 2.47
GUK1-231	ENST00000485859	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		30.48	■■■□□ 2.47
GUK1-231	ENST00000485859	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		30.48	■■■□□ 2.47
GUK1-231	ENST00000485859	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	30.46	■■■□□ 2.47
GUK1-231	ENST00000485859	SOGA1	O94964	1423 aa		30.42	■■■□□ 2.46
GUK1-231	ENST00000485859	WDR97	A6NE52	1622 aa		30.31	■■■□□ 2.44
GUK1-231	ENST00000485859	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	30.31	■■■□□ 2.44
GUK1-231	ENST00000485859	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	30.28	■■■□□ 2.44	3e-18	■■■■■ 76.4
GUK1-231	ENST00000485859	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		30.26	■■■□□ 2.43
GUK1-231	ENST00000485859	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	30.26	■■■□□ 2.43
GUK1-231	ENST00000485859	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		30.14	■■■□□ 2.41
GUK1-231	ENST00000485859	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		30.09	■■■□□ 2.41
GUK1-231	ENST00000485859	GRIN2B	Q13224	1484 aa		30.05	■■■□□ 2.4
GUK1-231	ENST00000485859	PBRM1	Q86U86	1689 aa		30.01	■■■□□ 2.4
GUK1-231	ENST00000485859	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		30.01	■■■□□ 2.4
GUK1-231	ENST00000485859	TRIM41	Q8WV44	630 aa		29.94	■■■□□ 2.38
GUK1-231	ENST00000485859	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	29.93	■■■□□ 2.38
GUK1-231	ENST00000485859	KIF27	Q86VH2	1401 aa		29.88	■■■□□ 2.37
GUK1-231	ENST00000485859	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		29.87	■■■□□ 2.37
GUK1-231	ENST00000485859	CHD1	O14646	1710 aa		29.87	■■■□□ 2.37
GUK1-231	ENST00000485859	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		29.84	■■■□□ 2.37
GUK1-231	ENST00000485859	ADAMTS12	P58397	1594 aa		29.83	■■■□□ 2.37
GUK1-231	ENST00000485859	SYNJ2	O15056	1496 aa		29.82	■■■□□ 2.36
GUK1-231	ENST00000485859	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		29.81	■■■□□ 2.36
GUK1-231	ENST00000485859	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		29.8	■■■□□ 2.36
GUK1-231	ENST00000485859	FBLN2	P98095	1184 aa		29.78	■■■□□ 2.36
GUK1-231	ENST00000485859	IGF1R	P08069	1367 aa		29.77	■■■□□ 2.36
GUK1-231	ENST00000485859	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		29.76	■■■□□ 2.35
GUK1-231	ENST00000485859	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		29.75	■■■□□ 2.35
GUK1-231	ENST00000485859	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	29.73	■■■□□ 2.35
GUK1-231	ENST00000485859	GRIN2A	Q12879	1464 aa		29.68	■■■□□ 2.34
GUK1-231	ENST00000485859	CUL7	Q14999	1698 aa		29.63	■■■□□ 2.33
GUK1-231	ENST00000485859	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		29.59	■■■□□ 2.33
GUK1-231	ENST00000485859	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		29.57	■■■□□ 2.32
GUK1-231	ENST00000485859	CEP170	Q5SW79	1584 aa		29.56	■■■□□ 2.32
GUK1-231	ENST00000485859	NUP160	Q12769	1436 aa		29.56	■■■□□ 2.32
GUK1-231	ENST00000485859	EEA1	Q15075	1411 aa		29.44	■■■□□ 2.3
GUK1-231	ENST00000485859	PRX	Q9BXM0	1461 aa		29.43	■■■□□ 2.3
GUK1-231	ENST00000485859	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		29.42	■■■□□ 2.3
GUK1-231	ENST00000485859	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		29.38	■■■□□ 2.29
GUK1-231	ENST00000485859	ARHGEF11	O15085	1522 aa		29.37	■■■□□ 2.29
GUK1-231	ENST00000485859	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	29.37	■■■□□ 2.29
GUK1-231	ENST00000485859	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		29.34	■■■□□ 2.29

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