Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNTAP49354 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNTAP49354 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNTAP49354 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNTAP49354 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNTAP49354 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNTAP49354 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNTAP49354 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FNTAP49354 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FNTAP49354 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FNTAP49354 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FNTAP49354 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FNTAP49354 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FNTAP49354 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FNTAP49354 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FNTAP49354 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FNTAP49354 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FNTAP49354 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FNTAP49354 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FNTAP49354 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FNTAP49354 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FNTAP49354 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FNTAP49354 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FNTAP49354 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FNTAP49354 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FNTAP49354 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FNTAP49354 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FNTAP49354 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FNTAP49354 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FNTAP49354 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FNTAP49354 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FNTAP49354 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FNTAP49354 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FNTAP49354 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FNTAP49354 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FNTAP49354 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FNTAP49354 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FNTAP49354 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FNTAP49354 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FNTAP49354 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FNTAP49354 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FNTAP49354 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FNTAP49354 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FNTAP49354 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FNTAP49354 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FNTAP49354 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FNTAP49354 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FNTAP49354 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FNTAP49354 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FNTAP49354 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FNTAP49354 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FNTAP49354 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FNTAP49354 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FNTAP49354 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FNTAP49354 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FNTAP49354 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FNTAP49354 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FNTAP49354 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FNTAP49354 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FNTAP49354 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FNTAP49354 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FNTAP49354 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FNTAP49354 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FNTAP49354 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FNTAP49354 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FNTAP49354 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FNTAP49354 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FNTAP49354 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FNTAP49354 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FNTAP49354 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FNTAP49354 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FNTAP49354 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FNTAP49354 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FNTAP49354 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FNTAP49354 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FNTAP49354 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FNTAP49354 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FNTAP49354 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FNTAP49354 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FNTAP49354 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FNTAP49354 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FNTAP49354 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FNTAP49354 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FNTAP49354 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FNTAP49354 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FNTAP49354 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FNTAP49354 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
FNTAP49354 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FNTAP49354 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FNTAP49354 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FNTAP49354 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FNTAP49354 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FNTAP49354 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FNTAP49354 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FNTAP49354 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FNTAP49354 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FNTAP49354 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
FNTAP49354 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
FNTAP49354 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
FNTAP49354 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms