Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRMUO75648 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRMUO75648 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRMUO75648 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TRMUO75648 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TRMUO75648 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRMUO75648 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRMUO75648 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TRMUO75648 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRMUO75648 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRMUO75648 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRMUO75648 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRMUO75648 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRMUO75648 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRMUO75648 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TRMUO75648 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRMUO75648 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRMUO75648 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRMUO75648 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRMUO75648 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRMUO75648 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRMUO75648 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRMUO75648 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRMUO75648 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRMUO75648 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRMUO75648 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRMUO75648 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRMUO75648 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRMUO75648 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRMUO75648 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRMUO75648 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRMUO75648 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRMUO75648 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRMUO75648 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRMUO75648 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRMUO75648 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRMUO75648 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRMUO75648 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRMUO75648 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRMUO75648 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRMUO75648 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRMUO75648 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRMUO75648 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRMUO75648 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRMUO75648 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRMUO75648 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRMUO75648 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRMUO75648 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRMUO75648 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRMUO75648 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRMUO75648 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRMUO75648 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRMUO75648 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRMUO75648 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRMUO75648 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRMUO75648 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRMUO75648 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRMUO75648 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRMUO75648 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRMUO75648 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRMUO75648 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRMUO75648 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRMUO75648 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRMUO75648 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRMUO75648 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRMUO75648 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRMUO75648 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRMUO75648 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRMUO75648 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRMUO75648 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRMUO75648 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRMUO75648 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMUO75648 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMUO75648 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMUO75648 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMUO75648 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMUO75648 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMUO75648 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMUO75648 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMUO75648 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMUO75648 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMUO75648 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMUO75648 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMUO75648 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMUO75648 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMUO75648 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMUO75648 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMUO75648 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMUO75648 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMUO75648 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMUO75648 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMUO75648 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMUO75648 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMUO75648 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMUO75648 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMUO75648 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMUO75648 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMUO75648 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMUO75648 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRMUO75648 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms