Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms