Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW22

DNAJA4, DnaJ homolog subfamily A member 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA4Q8WW22 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJA4Q8WW22 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJA4Q8WW22 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJA4Q8WW22 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJA4Q8WW22 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJA4Q8WW22 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJA4Q8WW22 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJA4Q8WW22 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJA4Q8WW22 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJA4Q8WW22 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJA4Q8WW22 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJA4Q8WW22 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJA4Q8WW22 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJA4Q8WW22 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJA4Q8WW22 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJA4Q8WW22 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAJA4Q8WW22 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAJA4Q8WW22 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAJA4Q8WW22 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAJA4Q8WW22 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAJA4Q8WW22 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAJA4Q8WW22 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAJA4Q8WW22 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAJA4Q8WW22 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAJA4Q8WW22 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAJA4Q8WW22 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAJA4Q8WW22 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAJA4Q8WW22 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAJA4Q8WW22 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAJA4Q8WW22 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAJA4Q8WW22 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAJA4Q8WW22 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAJA4Q8WW22 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAJA4Q8WW22 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAJA4Q8WW22 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAJA4Q8WW22 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAJA4Q8WW22 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAJA4Q8WW22 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAJA4Q8WW22 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms