Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
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TRAPPC6BQ86SZ2 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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TRAPPC6BQ86SZ2 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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TRAPPC6BQ86SZ2 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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TRAPPC6BQ86SZ2 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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TRAPPC6BQ86SZ2 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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