Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG87

PAPD7, Non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPD7Q5XG87 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAPD7Q5XG87 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms