Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms