Protein–RNA interactions for Protein: Q9UID3

VPS51, Vacuolar protein sorting-associated protein 51 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS51Q9UID3 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VPS51Q9UID3 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VPS51Q9UID3 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VPS51Q9UID3 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VPS51Q9UID3 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VPS51Q9UID3 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VPS51Q9UID3 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
VPS51Q9UID3 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VPS51Q9UID3 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VPS51Q9UID3 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VPS51Q9UID3 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VPS51Q9UID3 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VPS51Q9UID3 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VPS51Q9UID3 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VPS51Q9UID3 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VPS51Q9UID3 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VPS51Q9UID3 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
VPS51Q9UID3 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
VPS51Q9UID3 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VPS51Q9UID3 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
VPS51Q9UID3 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
VPS51Q9UID3 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VPS51Q9UID3 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VPS51Q9UID3 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VPS51Q9UID3 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VPS51Q9UID3 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VPS51Q9UID3 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VPS51Q9UID3 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VPS51Q9UID3 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VPS51Q9UID3 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VPS51Q9UID3 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VPS51Q9UID3 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
VPS51Q9UID3 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VPS51Q9UID3 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
VPS51Q9UID3 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VPS51Q9UID3 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VPS51Q9UID3 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VPS51Q9UID3 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VPS51Q9UID3 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VPS51Q9UID3 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VPS51Q9UID3 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VPS51Q9UID3 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VPS51Q9UID3 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VPS51Q9UID3 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VPS51Q9UID3 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VPS51Q9UID3 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VPS51Q9UID3 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VPS51Q9UID3 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VPS51Q9UID3 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VPS51Q9UID3 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VPS51Q9UID3 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VPS51Q9UID3 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VPS51Q9UID3 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VPS51Q9UID3 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VPS51Q9UID3 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
VPS51Q9UID3 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
VPS51Q9UID3 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VPS51Q9UID3 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VPS51Q9UID3 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VPS51Q9UID3 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VPS51Q9UID3 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VPS51Q9UID3 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VPS51Q9UID3 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VPS51Q9UID3 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VPS51Q9UID3 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VPS51Q9UID3 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VPS51Q9UID3 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VPS51Q9UID3 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VPS51Q9UID3 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VPS51Q9UID3 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VPS51Q9UID3 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VPS51Q9UID3 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VPS51Q9UID3 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VPS51Q9UID3 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VPS51Q9UID3 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VPS51Q9UID3 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VPS51Q9UID3 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VPS51Q9UID3 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VPS51Q9UID3 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VPS51Q9UID3 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VPS51Q9UID3 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VPS51Q9UID3 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
VPS51Q9UID3 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
VPS51Q9UID3 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VPS51Q9UID3 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VPS51Q9UID3 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VPS51Q9UID3 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VPS51Q9UID3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VPS51Q9UID3 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VPS51Q9UID3 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VPS51Q9UID3 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VPS51Q9UID3 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VPS51Q9UID3 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VPS51Q9UID3 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VPS51Q9UID3 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VPS51Q9UID3 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VPS51Q9UID3 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VPS51Q9UID3 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VPS51Q9UID3 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VPS51Q9UID3 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms