Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB39AQ14964 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms