Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms