Protein–RNA interactions for Protein: P18505

GABRB1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB1P18505 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB1P18505 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms