Protein–RNA interactions for Protein: P18505

GABRB1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB1P18505 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
GABRB1P18505 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
GABRB1P18505 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GABRB1P18505 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
GABRB1P18505 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GABRB1P18505 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GABRB1P18505 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GABRB1P18505 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
GABRB1P18505 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GABRB1P18505 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GABRB1P18505 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GABRB1P18505 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
GABRB1P18505 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GABRB1P18505 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
GABRB1P18505 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GABRB1P18505 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GABRB1P18505 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GABRB1P18505 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GABRB1P18505 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GABRB1P18505 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GABRB1P18505 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GABRB1P18505 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GABRB1P18505 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GABRB1P18505 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
GABRB1P18505 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GABRB1P18505 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GABRB1P18505 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GABRB1P18505 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GABRB1P18505 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GABRB1P18505 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GABRB1P18505 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GABRB1P18505 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GABRB1P18505 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GABRB1P18505 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GABRB1P18505 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GABRB1P18505 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GABRB1P18505 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GABRB1P18505 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GABRB1P18505 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GABRB1P18505 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GABRB1P18505 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GABRB1P18505 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GABRB1P18505 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GABRB1P18505 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GABRB1P18505 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GABRB1P18505 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GABRB1P18505 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GABRB1P18505 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GABRB1P18505 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GABRB1P18505 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GABRB1P18505 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GABRB1P18505 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GABRB1P18505 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GABRB1P18505 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GABRB1P18505 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GABRB1P18505 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GABRB1P18505 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GABRB1P18505 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GABRB1P18505 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GABRB1P18505 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GABRB1P18505 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GABRB1P18505 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GABRB1P18505 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GABRB1P18505 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GABRB1P18505 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GABRB1P18505 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GABRB1P18505 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GABRB1P18505 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GABRB1P18505 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GABRB1P18505 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GABRB1P18505 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GABRB1P18505 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
GABRB1P18505 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GABRB1P18505 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GABRB1P18505 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GABRB1P18505 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GABRB1P18505 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GABRB1P18505 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GABRB1P18505 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GABRB1P18505 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GABRB1P18505 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GABRB1P18505 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GABRB1P18505 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GABRB1P18505 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GABRB1P18505 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GABRB1P18505 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GABRB1P18505 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GABRB1P18505 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GABRB1P18505 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GABRB1P18505 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GABRB1P18505 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GABRB1P18505 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GABRB1P18505 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GABRB1P18505 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GABRB1P18505 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GABRB1P18505 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GABRB1P18505 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GABRB1P18505 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GABRB1P18505 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
GABRB1P18505 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms