Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RASGRF1Q13972 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
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