Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.312e-31■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.212e-31■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 SERF2-212ENST00000445816 2099 ntTSL 316.33■□□□□ 0.212e-31■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 SERF2-204ENST00000402131 586 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.12e-31■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 SERF2-205ENST00000403425 690 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.092e-31■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 SERF2-210ENST00000409960 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.092e-31■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 SERF2-202ENST00000339624 506 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.252e-31■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.131e-10■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.771e-10■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.771e-10■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.431e-10■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 PPP1R18-204ENST00000488324 1328 ntTSL 317.22■□□□□ 0.351e-10■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 PPP1R18-203ENST00000467662 1156 ntTSL 314.76□□□□□ -0.051e-10■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 PPP1R18-202ENST00000399199 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.221e-10■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 ATP5I-202ENST00000505852 300 ntTSL 212.15□□□□□ -0.463e-19■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 ATP5I-201ENST00000304312 365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.583e-19■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 CHMP1A-204ENST00000547687 2007 ntTSL 1 (best)18.67■□□□□ 0.584e-8■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.414e-8■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.364e-8■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.498e-7■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.778e-7■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.668e-7■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.662e-9■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.622e-9■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 BRPF1-206ENST00000457855 4308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.852e-9■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC17.63■□□□□ 0.411e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.623e-50■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 HMGB2-201ENST00000296503 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.13e-50■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 HMGB2-205ENST00000511316 1841 ntTSL 214.32□□□□□ -0.123e-50■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 HMGB2-202ENST00000438704 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.043e-50■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 ARF3-204ENST00000485410 563 ntTSL 323.29■■□□□ 1.322e-13■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 EPB41-208ENST00000460378 5212 ntTSL 1 (best)12.05□□□□□ -0.489e-11■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 EPB41-204ENST00000356093 5857 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.769e-11■■□□□ 14.1
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PABPC4Q13310 EPB41-201ENST00000343067 5956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.19e-11■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 KHDRBS1-203ENST00000484270 1989 ntTSL 521.53■■□□□ 1.045e-8■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 KHDRBS1-201ENST00000307714 2738 ntTSL 1 (best)21.05■□□□□ 0.965e-8■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.35e-8■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 TXN2-202ENST00000403313 912 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.137e-7■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.381e-13■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 ANXA2-203ENST00000421017 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.621e-13■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 ANXA2-204ENST00000451270 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.691e-13■■□□□ 14.1
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PABPC4Q13310 ANXA2-202ENST00000396024 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.821e-13■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 ANXA2-228ENST00000560014 2339 ntTSL 29.66□□□□□ -0.861e-13■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 ETFA-210ENST00000559973 804 ntTSL 38.8□□□□□ -12e-10■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 MRPL52-206ENST00000461594 375 ntTSL 316.73■□□□□ 0.272e-9■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 EIF3L-214ENST00000624234 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.246e-11■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 EIF3L-203ENST00000412331 3220 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.166e-11■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 LSM3-201ENST00000306024 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.512e-15■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 MAZ-207ENST00000563012 646 ntTSL 324.15■■□□□ 1.465e-29■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 PAXX-203ENST00000467845 744 ntTSL 220.36■□□□□ 0.856e-7■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 FBL-210ENST00000599159 1400 ntTSL 1 (best)26.82■■□□□ 1.885e-12■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 FBL-203ENST00000594309 603 ntTSL 226.42■■□□□ 1.825e-12■■□□□ 14.1
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PABPC4Q13310 COPB2-201ENST00000333188 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.798e-11■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.458e-11■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 COPB2-203ENST00000503326 433 ntTSL 34.75□□□□□ -1.658e-11■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.145e-8■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.115e-8■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.775e-8■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.832e-8■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.224e-9■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 RPLP1-202ENST00000357790 445 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.12e-44■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 RPLP1-203ENST00000487304 1962 ntTSL 513.67□□□□□ -0.222e-44■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 RPLP1-201ENST00000260379 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.472e-44■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 MDK-208ENST00000481047 775 ntTSL 227.89■■■□□ 2.061e-7■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 MDK-212ENST00000533952 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 324.25■■□□□ 1.471e-7■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 MDK-210ENST00000490240 603 ntTSL 1 (best)22.95■■□□□ 1.261e-7■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 TXNIP-203ENST00000488537 1509 ntTSL 58.39□□□□□ -1.071e-49■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 TXNIP-202ENST00000486597 509 ntTSL 25.44□□□□□ -1.541e-49■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.482e-7■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 DPP7-205ENST00000472306 919 ntTSL 527.47■■□□□ 1.991e-6■■□□□ 14.1
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PABPC4Q13310 MDK-211ENST00000533283 498 ntTSL 318.17■□□□□ 0.51e-7■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 EWSR1-205ENST00000360091 1289 ntTSL 523.76■■□□□ 1.391e-6■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 EWSR1-218ENST00000483629 1818 ntTSL 520.38■□□□□ 0.851e-6■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.611e-6■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.591e-6■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.561e-6■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.51e-6■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 EWSR1-215ENST00000469669 2630 ntTSL 217.89■□□□□ 0.451e-6■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 EWSR1-216ENST00000479135 7285 ntTSL 1 (best)11.47□□□□□ -0.571e-6■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 TTC31-204ENST00000424122 2806 ntTSL 1 (best)12.09□□□□□ -0.471e-17■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 TTC31-201ENST00000233623 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.551e-17■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 TTC31-213ENST00000491252 3860 ntTSL 211.28□□□□□ -0.61e-17■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 TTC31-202ENST00000410003 3358 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.671e-17■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 TTC31-212ENST00000489152 4025 ntTSL 210.59□□□□□ -0.711e-17■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 ATG12-202ENST00000500945 1430 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.991e-17■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 ATG12-203ENST00000505252 3274 ntTSL 1 (best)5.49□□□□□ -1.531e-17■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.661e-17■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 CBR4-207ENST00000510042 1198 ntTSL 214.26□□□□□ -0.132e-7■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 CBR4-201ENST00000306193 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.132e-7■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 CBR4-206ENST00000509108 546 ntTSL 34.44□□□□□ -1.72e-7■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.192e-6■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 PSMA6-206ENST00000554541 925 ntTSL 214.05□□□□□ -0.162e-6■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 PSMA6-211ENST00000555764 1002 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.452e-6■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 PSMA6-202ENST00000540871 912 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.832e-6■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 PSMA6-209ENST00000554961 814 ntTSL 29.72□□□□□ -0.852e-6■■□□□ 14.1
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