Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATF3P18847 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATF3P18847 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATF3P18847 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATF3P18847 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATF3P18847 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATF3P18847 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ATF3P18847 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATF3P18847 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATF3P18847 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATF3P18847 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATF3P18847 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ATF3P18847 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ATF3P18847 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATF3P18847 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATF3P18847 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ATF3P18847 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATF3P18847 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATF3P18847 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATF3P18847 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATF3P18847 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATF3P18847 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATF3P18847 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATF3P18847 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATF3P18847 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATF3P18847 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATF3P18847 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATF3P18847 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATF3P18847 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATF3P18847 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATF3P18847 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATF3P18847 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATF3P18847 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATF3P18847 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATF3P18847 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATF3P18847 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATF3P18847 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATF3P18847 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATF3P18847 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATF3P18847 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATF3P18847 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATF3P18847 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATF3P18847 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATF3P18847 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATF3P18847 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATF3P18847 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATF3P18847 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATF3P18847 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATF3P18847 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATF3P18847 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATF3P18847 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATF3P18847 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATF3P18847 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATF3P18847 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATF3P18847 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATF3P18847 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATF3P18847 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATF3P18847 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF3P18847 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF3P18847 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF3P18847 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF3P18847 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF3P18847 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF3P18847 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF3P18847 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF3P18847 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF3P18847 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF3P18847 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF3P18847 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF3P18847 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF3P18847 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF3P18847 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF3P18847 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF3P18847 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF3P18847 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF3P18847 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF3P18847 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF3P18847 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF3P18847 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF3P18847 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF3P18847 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF3P18847 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF3P18847 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF3P18847 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF3P18847 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF3P18847 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF3P18847 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF3P18847 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF3P18847 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF3P18847 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF3P18847 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF3P18847 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF3P18847 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF3P18847 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF3P18847 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF3P18847 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF3P18847 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF3P18847 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF3P18847 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF3P18847 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms