Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVL8

CPO, Carboxypeptidase O, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPOQ8IVL8 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CPOQ8IVL8 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms