Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 RNF4-201ENST00000314289 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.822e-7■■■■■ 29.5
PRPF8Q6P2Q9 RNF4-222ENST00000541204 2796 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.862e-7■■■■■ 29.5
PRPF8Q6P2Q9 RNF4-212ENST00000509258 893 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.892e-7■■■■■ 29.5
PRPF8Q6P2Q9 RNF4-221ENST00000513643 516 ntTSL 38.3□□□□□ -1.082e-7■■■■■ 29.5
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PRPF8Q6P2Q9 ZNF564-201ENST00000339282 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.772e-8■■■■■ 29.4
PRPF8Q6P2Q9 AC010422.6-201ENST00000593682 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.992e-8■■■■■ 29.4
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PRPF8Q6P2Q9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.136e-7■■■■■ 29.4
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PRPF8Q6P2Q9 HDAC2-205ENST00000519065 9874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.674e-7■■■■■ 29.4
PRPF8Q6P2Q9 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.684e-7■■■■■ 29.4
PRPF8Q6P2Q9 WAC-213ENST00000472862 2229 ntTSL 27.3□□□□□ -1.247e-7■■■■■ 29.4
PRPF8Q6P2Q9 MED17-205ENST00000528786 656 ntTSL 517.69■□□□□ 0.429e-9■■■■■ 29.4
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PRPF8Q6P2Q9 EIF4A1-215ENST00000580886 562 ntTSL 28.23□□□□□ -1.091e-38■■■■■ 29.4
PRPF8Q6P2Q9 EIF4A1-212ENST00000579085 569 ntTSL 48.03□□□□□ -1.121e-38■■■■■ 29.4
PRPF8Q6P2Q9 HNRNPH1-227ENST00000515481 5564 ntTSL 24.4□□□□□ -1.72e-14■■■■■ 29.4
PRPF8Q6P2Q9 MBTD1-205ENST00000586898 534 ntTSL 40.46□□□□□ -2.342e-6■■■■■ 29.4
PRPF8Q6P2Q9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.259e-7■■■■■ 29.4
PRPF8Q6P2Q9 MTA2-207ENST00000532239 532 ntTSL 412.82□□□□□ -0.366e-8■■■■■ 29.4
PRPF8Q6P2Q9 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.419e-7■■■■■ 29.4
PRPF8Q6P2Q9 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.439e-7■■■■■ 29.4
PRPF8Q6P2Q9 RGN-205ENST00000469346 1820 ntTSL 515.2■□□□□ 0.029e-12■■■■■ 29.4
PRPF8Q6P2Q9 TTLL4-201ENST00000258398 4730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.354e-7■■■■■ 29.4
PRPF8Q6P2Q9 RALGAPA1-209ENST00000554652 4487 ntTSL 24.34□□□□□ -1.715e-7■■■■■ 29.4
PRPF8Q6P2Q9 TRIM65-203ENST00000540812 385 ntTSL 214.2□□□□□ -0.141e-6■■■■■ 29.4
PRPF8Q6P2Q9 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.289e-7■■■■■ 29.4
PRPF8Q6P2Q9 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.399e-7■■■■■ 29.4
PRPF8Q6P2Q9 SPIDR-206ENST00000518074 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.019e-7■■■■■ 29.4
PRPF8Q6P2Q9 SPIDR-217ENST00000522117 2745 ntTSL 28.14□□□□□ -1.119e-7■■■■■ 29.4
PRPF8Q6P2Q9 SPIDR-224ENST00000524126 2614 ntTSL 1 (best)7.23□□□□□ -1.259e-7■■■■■ 29.4
PRPF8Q6P2Q9 GTF3C1-212ENST00000570129 505 ntTSL 58.2□□□□□ -1.11e-6■■■■■ 29.4
PRPF8Q6P2Q9 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.051e-6■■■■■ 29.4
PRPF8Q6P2Q9 LPCAT3-203ENST00000535479 2902 ntTSL 1 (best)11.02□□□□□ -0.651e-6■■■■■ 29.4
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