RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555837.5

CDKN3-208, Transcript of cyclin dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

TSL 2

Gene CDKN3, Length 689 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3-208ENST00000555837 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.2■■■■■ 6.43
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CDKN3-208ENST00000555837 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.95■■■■■ 4.95
CDKN3-208ENST00000555837 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.78■■■■■ 4.92
CDKN3-208ENST00000555837 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45■■■■■ 4.79
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CDKN3-208ENST00000555837 SCRIBQ14160 1630 aa44.69■■■■■ 4.74
CDKN3-208ENST00000555837 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.67■■■■■ 4.74
CDKN3-208ENST00000555837 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.56■■■■■ 4.72
CDKN3-208ENST00000555837 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.88■■■■■ 4.62
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CDKN3-208ENST00000555837 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.4■■■■■ 4.54
CDKN3-208ENST00000555837 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.19■■■■■ 4.5
CDKN3-208ENST00000555837 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.87■■■■■ 4.45
CDKN3-208ENST00000555837 SMARCA4P51532 1647 aa42.81■■■■■ 4.44
CDKN3-208ENST00000555837 SMARCA2P51531 1590 aa42.68■■■■■ 4.42
CDKN3-208ENST00000555837 NCAPD3P42695 1498 aa42.64■■■■■ 4.42
CDKN3-208ENST00000555837 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.6■■■■■ 4.41
CDKN3-208ENST00000555837 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.44■■■■■ 4.39
CDKN3-208ENST00000555837 HMGXB3Q12766 1538 aa42.44■■■■■ 4.38
CDKN3-208ENST00000555837 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.44■■■■■ 4.38
CDKN3-208ENST00000555837 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.32■■■■■ 4.37
CDKN3-208ENST00000555837 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.01■■■■■ 4.32
CDKN3-208ENST00000555837 WIZO95785 1651 aa41.96■■■■■ 4.31
CDKN3-208ENST00000555837 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.64■■■■■ 4.26
CDKN3-208ENST00000555837 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.56■■■■■ 4.24
CDKN3-208ENST00000555837 ERCC6Q03468 1493 aa41.52■■■■■ 4.24
CDKN3-208ENST00000555837 NESP48681 1621 aa41.41■■■■■ 4.22
CDKN3-208ENST00000555837 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.41■■■■■ 4.22
CDKN3-208ENST00000555837 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.35■■■■■ 4.21
CDKN3-208ENST00000555837 CFTRP13569 1480 aa41.13■■■■■ 4.17
CDKN3-208ENST00000555837 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.1■■■■■ 4.17
CDKN3-208ENST00000555837 CUX2O14529 1486 aa41.09■■■■■ 4.17
CDKN3-208ENST00000555837 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.98■■■■■ 4.15
CDKN3-208ENST00000555837 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.98■■■■■ 4.15
CDKN3-208ENST00000555837 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.9■■■■■ 4.14
CDKN3-208ENST00000555837 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.9■■■■■ 4.14
CDKN3-208ENST00000555837 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.86■■■■■ 4.13
CDKN3-208ENST00000555837 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.82■■■■■ 4.12
CDKN3-208ENST00000555837 PRDM2Q13029 1718 aa40.8■■■■■ 4.12
CDKN3-208ENST00000555837 WDR62O43379 1518 aa40.64■■■■■ 4.1
CDKN3-208ENST00000555837 ABCC8Q09428 1581 aa40.44■■■■■ 4.06
CDKN3-208ENST00000555837 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.38■■■■■ 4.06
CDKN3-208ENST00000555837 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.21■■■■■ 4.03
CDKN3-208ENST00000555837 TOPBP1Q92547 1522 aa40.21■■■■■ 4.03
CDKN3-208ENST00000555837 IFT140Q96RY7 1462 aa40.07■■■■■ 4
CDKN3-208ENST00000555837 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.85■■■■□ 3.97
CDKN3-208ENST00000555837 CUX1P39880 1505 aa39.83■■■■□ 3.97
CDKN3-208ENST00000555837 SOGA1O94964 1423 aa39.78■■■■□ 3.96
CDKN3-208ENST00000555837 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.78■■■■□ 3.96
CDKN3-208ENST00000555837 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.75■■■■□ 3.95
CDKN3-208ENST00000555837 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.72■■■■□ 3.95
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CDKN3-208ENST00000555837 WDR97A6NE52 1622 aa39.65■■■■□ 3.94
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CDKN3-208ENST00000555837 TOP2BQ02880 1626 aa39.58■■■■□ 3.93
CDKN3-208ENST00000555837 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.54■■■■□ 3.92
CDKN3-208ENST00000555837 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.51■■■■□ 3.92
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CDKN3-208ENST00000555837 OSCARQ8IYS5 282 aa39.44■■■■□ 3.9
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CDKN3-208ENST00000555837 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.31■■■■□ 3.88
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CDKN3-208ENST00000555837 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.2■■■■□ 3.87
CDKN3-208ENST00000555837 FBLN2P98095 1184 aa39.18■■■■□ 3.86
CDKN3-208ENST00000555837 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.17■■■■□ 3.86
CDKN3-208ENST00000555837 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.14■■■■□ 3.86
CDKN3-208ENST00000555837 PBRM1Q86U86 1689 aa39.13■■■■□ 3.86
CDKN3-208ENST00000555837 SYNJ2O15056 1496 aa39.07■■■■□ 3.85
CDKN3-208ENST00000555837 CHD1O14646 1710 aa39.06■■■■□ 3.84
CDKN3-208ENST00000555837 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.01■■■■□ 3.84
CDKN3-208ENST00000555837 KIF27Q86VH2 1401 aa38.96■■■■□ 3.83
CDKN3-208ENST00000555837 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.89■■■■□ 3.82
CDKN3-208ENST00000555837 TRIM41Q8WV44 630 aa38.84■■■■□ 3.81
CDKN3-208ENST00000555837 ADAMTS12P58397 1594 aa38.83■■■■□ 3.81
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CDKN3-208ENST00000555837 IGF1RP08069 1367 aa38.68■■■■□ 3.78
CDKN3-208ENST00000555837 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.67■■■■□ 3.78
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CDKN3-208ENST00000555837 ARHGEF11O15085 1522 aa38.63■■■■□ 3.77
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CDKN3-208ENST00000555837 NUP160Q12769 1436 aa38.59■■■■□ 3.77
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CDKN3-208ENST00000555837 CEP170Q5SW79 1584 aa38.47■■■■□ 3.75
CDKN3-208ENST00000555837 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.33■■■■□ 3.73
CDKN3-208ENST00000555837 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa38.29■■■■□ 3.72
CDKN3-208ENST00000555837 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa38.29■■■■□ 3.72
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CDKN3-208ENST00000555837 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.28■■■■□ 3.72
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