Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms