Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP1P29466 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP1P29466 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP1P29466 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP1P29466 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP1P29466 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP1P29466 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP1P29466 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP1P29466 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP1P29466 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP1P29466 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP1P29466 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASP1P29466 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASP1P29466 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASP1P29466 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASP1P29466 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASP1P29466 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASP1P29466 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASP1P29466 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASP1P29466 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASP1P29466 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASP1P29466 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASP1P29466 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASP1P29466 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASP1P29466 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASP1P29466 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CASP1P29466 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASP1P29466 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASP1P29466 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASP1P29466 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASP1P29466 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASP1P29466 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASP1P29466 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASP1P29466 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASP1P29466 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASP1P29466 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASP1P29466 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASP1P29466 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASP1P29466 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASP1P29466 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASP1P29466 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASP1P29466 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASP1P29466 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASP1P29466 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASP1P29466 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASP1P29466 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASP1P29466 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASP1P29466 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASP1P29466 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASP1P29466 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASP1P29466 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASP1P29466 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CASP1P29466 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASP1P29466 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASP1P29466 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASP1P29466 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASP1P29466 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASP1P29466 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASP1P29466 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASP1P29466 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASP1P29466 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASP1P29466 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASP1P29466 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASP1P29466 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASP1P29466 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASP1P29466 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASP1P29466 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASP1P29466 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASP1P29466 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASP1P29466 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASP1P29466 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASP1P29466 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASP1P29466 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASP1P29466 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASP1P29466 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASP1P29466 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CASP1P29466 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASP1P29466 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASP1P29466 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASP1P29466 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASP1P29466 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASP1P29466 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASP1P29466 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASP1P29466 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CASP1P29466 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASP1P29466 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASP1P29466 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASP1P29466 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASP1P29466 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASP1P29466 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASP1P29466 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASP1P29466 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASP1P29466 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CASP1P29466 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASP1P29466 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASP1P29466 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASP1P29466 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CASP1P29466 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASP1P29466 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASP1P29466 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms